典型文献
丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)家族在脑胶质瘤中的免疫相关性及预后价值的生物信息学分析
文献摘要:
目的 分析丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)基因家族在胶质瘤中的表达、免疫浸润情况及其与预后的相关性.方法 通过利用R语言及多个生物信息学分析数据库,探究SERPIN家族35个基因在癌症基因组图谱(TCGA)胶质瘤肿瘤组织中的变化;选择差异显著的基因,在基因表达谱动态分析(GEPIA)数据库中分析各候选基因高、低表达肿瘤患者的总生存期(OS)和无病生存期(DFS)差异,并进一步筛选最具有预后评价价值的基因;通过肿瘤免疫评估资源2.0(TIMER2.0)数据库及肿瘤微环境单细胞转录组学(TISCH)数据库分析基因在泛癌水平表达、在肿瘤组织内细胞集群富集情况及巨噬细胞与胶质瘤内部SERPIN基因表达浸润的相关性,探究SERPIN与肿瘤免疫之间的关系.结果 SERPIN家族中多个基因的表达量均在胶质瘤中有不同程度的改变,且与胶质瘤分级,预后显著相关.其中丝氨酸蛋白酶抑制剂E2(SERPINE2)、丝氨酸蛋白酶抑制剂H1(SERPINH1)与高级别胶质瘤患者预后存在明显相关性,且二者可能通过对免疫细胞的不同交互途径参与肿瘤免疫微环境内部的免疫调控.结论 SERPIN基因家族的表达同胶质瘤患者的临床预后,肿瘤免疫活动存在密切联系,其中SERPINE2、SERPINH1为效应显著的关键基因.
文献关键词:
丝氨酸蛋白酶抑制剂E2(SERPINE2);丝氨酸蛋白酶抑制剂H1(SERPINH1);胶质瘤;预后分析;免疫浸润
中图分类号:
作者姓名:
贾怡斌;王冠一;贺晓生
作者机构:
空军军医大学西京医院神经外科,陕西西安710032
文献出处:
引用格式:
[1]贾怡斌;王冠一;贺晓生-.丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)家族在脑胶质瘤中的免疫相关性及预后价值的生物信息学分析)[J].细胞与分子免疫学杂志,2022(02):122-130
A类:
SERPIN,SERPINE2,SERPINH1
B类:
丝氨酸蛋白酶抑制剂,脑胶质瘤,免疫相关,预后价值,生物信息学分析,基因家族,免疫浸润,言及,癌症基因组图谱,TCGA,肿瘤组织,选择差异,基因表达谱,动态分析,GEPIA,候选基因,低表达,肿瘤患者,总生存期,OS,无病生存期,DFS,预后评价,评价价值,免疫评估,TIMER2,肿瘤微环境,单细胞转录组,转录组学,TISCH,数据库分析,泛癌,巨噬细胞,胶质瘤分级,高级别胶质瘤,免疫细胞,肿瘤免疫微环境,免疫调控,临床预后,关键基因,预后分析
AB值:
0.219586
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。