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典型文献
南京地区HIV-1 CRF01_AE毒株分子流行特征及传播网络分析
文献摘要:
目的 了解南京地区HIV-1CRF01_AE毒株分子流行特征及传播网络情况,为该毒株的疫情防控提供参考依据.方法 收集2015年9月至2019年6月南京市新确诊的HIV-1感染者血样及人口学信息.扩增HIV-1pol区基因片段,经判定CRF01_AE毒株共401条.以最大似然法构建系统进化树;通过Tamura-Nei93成对基因距离法构建传播网络并分析其特征.结果 CRF01_AE毒株在南京地区共形成了 3个全国相关流行枝(Clade 4a、Clade 4b、Clade 5)以及1个独特的南京流行枝(NJ-Clade),这4个流行枝分别包括23.69%(95/401)、18.20%(73/401)、13.72%(55/401)和30.92%(124/401)的南京序列.NJ-Clade中感染者年龄显著低于其他流行枝(x2=34.286,P<0.001),并且具有更高比例的同性性向(x2=19.129,P:0.024)和男男性行为(x2=14.293,P=0.027).71.82%(288/401)的CRF01_AE毒株形成 83 个传播网络.多因素分析显示,相比 Clade 4a(aOR=0.464)、Clade 4b(aOR=0.363)、Clade 5(aOR=0.483)流行枝,NJ-Clade具有更高的网络形成率.结论 南京地区HIV-1 CRF01_AE毒株流行情况复杂,除包含全国相关流行枝外,已形成了独特的南京流行枝,应持续监测各流行枝的进化传播情况.
文献关键词:
1型艾滋病病毒;CRF01_AE毒株;病毒进化;艾滋病;传播网络
作者姓名:
刘洋阳;李睿;李小杉;李伟;储金金;卫平民
作者机构:
东南大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,南京210009;南京医科大学附属无锡人民医院,江苏无锡214023;南京医科大学附属儿童医院,南京210008
文献出处:
引用格式:
[1]刘洋阳;李睿;李小杉;李伟;储金金;卫平民-.南京地区HIV-1 CRF01_AE毒株分子流行特征及传播网络分析)[J].中国艾滋病性病,2022(05):519-524
A类:
1CRF01,Nei93
B类:
南京地区,HIV,AE,毒株,分子流行特征,传播网络,新确诊,感染者,血样,人口学,1pol,最大似然法,建系,系统进化树,Tamura,基因距离,共形,国相,Clade,4a,4b,NJ,x2,高比例,性向,男男性行为,多因素分析,aOR,网络形成,流行情况,应持,持续监测,艾滋病病毒,病毒进化
AB值:
0.281778
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