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典型文献
北京市2018-2019年献血筛查发现的HIV-1毒株分子特征研究
文献摘要:
目的 分析北京市献血者中筛查出的人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)感染者流行毒株及分子传播特征,为献血人群的艾滋病防治工作提供数据.方法 对2018-2019年献血筛查HIV-1阳性而报废的血液样本118份,针对病毒pol区部分片段进行基因扩增和测序,运用系统进化分析技术构建贝叶斯(Bayesian inference,BI)和最大似然(Maximum Likelihood,ML)系统进化树,确定HIV毒株亚型,并与从NCBI数据库下载来自中国各省份的23 823条HIV-1序列应用HyPhy2.2.4与Cytoscape3.7.2软件构建分子传播网络.结果 从收集HIV-1阳性报废血液样本成功获得pol区基因序列118条,系统进化分析显示,主要亚型为CRF01_AE 54份(占45.8%)和 CRF07_BC 48 份(占 40.7%).CRF01_AE 中的 Cluster 4和 Cluster 5 簇和 CRF07_BC 的 MSM 簇,所占比例分别为 25.4%(30/118)、20.3%(24/118)和34.7%(41/118).在0.5%基因距离阈值下,共有14条序列与数据库中序列发生关联;进入分子网络中HIV-1毒株亚型包括CRF01_AE(6例)、CRF07_BC(6例)、B(1例)和CRF67_O1B(1例).献血人群中的HIV感染者在分子网络中与12个省的HIV感染人群病毒序列相关联,重点关联的依次为来源于北京、上海、深圳三个大城市MSM人群的感染毒株.结论 北京市献血者筛查出的主要HIV-1流行毒株为CRF01_AE和CRF07_BC,在MSM人群占据优势的CRFO1_AE Cluster 4、CRF01_AE Cluster 5和CRF07_BC MSM簇,在献血筛查HIV-1阳性人群中同样属于主要流行簇.分子网络分析未发现该人群中大规模的聚集性传播,进入分子网络的毒株主要与北京、上海、深圳三个大城市来源于MSM人群感染毒株相关联.提示强化献血人群健康教育,有效阻断有高危行为的MSM人群参与献血.
文献关键词:
人类免疫缺陷病毒;无偿献血;分子传播网络;男男性行为者
作者姓名:
高占;刘正敏;陈立;孙婧
作者机构:
北京市红十字血液中心,北京 100088
文献出处:
引用格式:
[1]高占;刘正敏;陈立;孙婧-.北京市2018-2019年献血筛查发现的HIV-1毒株分子特征研究)[J].中国热带医学,2022(06):565-569
A类:
HyPhy2,CRF67,O1B,CRFO1
B类:
HIV,分子特征,献血者,查出,人类免疫缺陷病毒,human,immunodeficiency,virus,type,感染者,流行毒株,传播特征,献血人群,艾滋病防治,防治工作,报废,血液样本,pol,分片,基因扩增,系统进化分析,技术构建,Bayesian,inference,最大似然,Maximum,Likelihood,ML,系统进化树,毒株亚型,NCBI,下载,载来,Cytoscape3,软件构建,分子传播网络,基因序列,CRF01,AE,CRF07,BC,Cluster,MSM,基因距离,距离阈值,阈值下,分子网络,序列相关,相关联,染毒,该人,聚集性,性传播,人群健康,高危行为,无偿献血,男男性行为者
AB值:
0.275075
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