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典型文献
浙西南山区HIV-1毒株分子传播网络特征分析
文献摘要:
目的:了解浙西南山区(丽水市)人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染者和艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome,AIDS)患者的分子传播网络特征。方法:收集丽水市2020年新确证且未经抗病毒治疗HIV/AIDS感染病例血样共147例,扩增HIV-1 pol区基因并测序。使用MEGA6.0软件构建系统进化树判断亚型,HIVDB在线分析治疗前耐药突变及耐药水平;计算两两序列间基因距离(genetic distance,GD),确定最佳GD阈值,通过Cytoscape3.7.0软件绘制分子传播网络图。统计学方法采用χ 2或Fisher精确概率法。 结果:成功得到134条 pol基因序列,共发现9种亚型,以CRF08_BC (34.33%,46/134),CRF01_AE (29.85%,40/134)和CRF07_BC (23.88%,32/134)为主,年龄、户籍地、教育程度和传播途径对亚型分布的差异均有统计学意义( P<0.05)。发现19个样本存在耐药,治疗前人群耐药率为14.18%(19/134)。以GD阈值为1.2%绘制HIV-1分子传播网络图,形成15个分子簇(簇内患者数2~29例),入网率49.25%(66/134),入网病例以男性(75.76%,50/66)、异性性传播(81.82%,54/66)和感染CRF08_BC(50.00%,33/66)为主。发现一个包含29个病例(其中2例暗娼)的CRF08_BC较大分子簇(平均度值22.7),簇内病例集中在S县,平均年龄57.21岁,异性性传播为主(96.55%, 28/29),包括7例耐药病例,簇内序列的同源性分析显示与云南流行株的关联性最高。 结论:浙西南山区(丽水市)HIV-1亚型多元,治疗前耐药达到较高水平,发现特定区域存在以老年嫖客为聚集特征的分子传播簇,急需制定和实施精准干预策略,遏制HIV的传播。
文献关键词:
HIV-1;亚型;分子传播网络;传播特征
作者姓名:
叶灵;王晓光;杨秀丽;陈晓蕾;陈秀英;张海芳;夏永玲;范钦;张佳峰
作者机构:
丽水市疾病预防控制中心检验检测所,丽水 323000;浙江省疾病预防控制中心艾滋病与性病预防控制所,杭州 310051
引用格式:
[1]叶灵;王晓光;杨秀丽;陈晓蕾;陈秀英;张海芳;夏永玲;范钦;张佳峰-.浙西南山区HIV-1毒株分子传播网络特征分析)[J].中华微生物学和免疫学杂志,2022(02):94-100
A类:
HIVDB
B类:
浙西南,西南山区,毒株,分子传播网络,网络特征,丽水市,人类免疫缺陷病毒,human,immunodeficiency,virus,感染者,艾滋病,acquired,syndrome,AIDS,确证,抗病毒治疗,感染病,血样,pol,MEGA6,软件构建,建系,系统进化树,在线分析,治疗前耐药,耐药突变,耐药水平,基因距离,genetic,distance,GD,Cytoscape3,网络图,统计学方法,Fisher,概率法,基因序列,CRF08,BC,CRF01,AE,CRF07,户籍地,传播途径,亚型分布,耐药率,分子簇,内患,入网,性传播,一个包,暗娼,大分子,平均度,平均年龄,同源性分析,南流,特定区域,嫖客,传播簇,制定和实施,实施精准,精准干预,干预策略,传播特征
AB值:
0.37849
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