典型文献
急性髓系白血病中受组蛋白修饰和DNA甲基化影响的关键基因分析
文献摘要：
已有研究证明,基因表达水平的变化受组蛋白修饰和DNA甲基化的影响,寻找受影响的关键基因有助于急性髓系白血病的诊断和治疗.本研究从TCGA、ENCODE、GTEx和GEO几个数据库下载数据,通过R包和生物信息学工具,对基因表达数据和DNA甲基化数据进行差异分析,利用MACS2子命令分析K562和GM12878细胞系中11种组蛋白修饰的显著差异peaks,并注释相关联于各区域的基因.相关性分析发现H3K4me2和H3K27ac两种组蛋白修饰之间显著相关,并与K562细胞系基因表达水平唯一显著正相关,通过整合基因表达数据和甲基化数据,寻找出不同表观遗传调控的差异基因7个,其中GADD45B和ESYT2的Body区受甲基化的调控,启动子区分别受到H3K4me2和H3K27ac两种组蛋白修饰影响.最后,通过急性髓系白血病患者的基因表达数据联合临床数据对关键基因建立预后模型,结果显示一些关键基因对急性髓系白血病患者的生存时间有一定的影响.
文献关键词：
DNA甲基化;组蛋白修饰;基因表达;关键基因;生存分析
中图分类号：
作者姓名：
谢茜茜;张晓炜;刘暘;樊国梁
作者机构：
内蒙古大学物理科学与技术学院,呼和浩特010021;内蒙古医科大学第一附属医院风湿免疫科,呼和浩特010050
文献出处：
引用格式：
[1]谢茜茜;张晓炜;刘暘;樊国梁-.急性髓系白血病中受组蛋白修饰和DNA甲基化影响的关键基因分析)[J].内蒙古大学学报（自然科学版）,2022(06):611-620
A类：
MACS2,GM12878,H3K4me2,GADD45B,ESYT2
B类：
急性髓系白血病,组蛋白修饰,甲基化,关键基因,基因分析,基因表达水平,诊断和治疗,TCGA,ENCODE,GTEx,GEO,下载数据,生物信息学工具,基因表达数据,命令,K562,细胞系,peaks,相关联,联于,H3K27ac,表观遗传调控,差异基因,Body,启动子区,白血病患者,临床数据,预后模型,生存时间,生存分析
AB值：
0.231445
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