典型文献
两种诱变处理下紫花苜蓿全基因组DNA甲基化图谱分析
文献摘要：
为了探究不同诱变处理对紫花苜蓿表观遗传学效应的影响,试验采用甲基磺酸乙酯(EM S)和60 CO-γ两种诱变方法对紫花苜蓿种子进行处理,采用重亚硫酸盐测序(BS-seq)技术,对紫花苜蓿诱变前后全基因组DNA甲基化图谱进行分析.结果表明,紫花苜蓿体内的DNA甲基化主要有mCG,mCHH和mCHG 3种类型;C位点发生甲基化的比率在EMS诱变处理下表现为上升,在60 CO-γ诱变处理下表现为下降.此外,DNA甲基化主要发生在CG序列;对不同诱变处理组的差异甲基化区域(DMR)鉴定发现有105个基因在两组比较中均存在DMR,KEGG通路富集分析表明,在DM R相关基因中显著富集的通路主要包括氮代谢通路(Nitrogen metabolism)、淀粉和蔗糖代谢途径(Starch and sucrose metabolism)、脯氨酸代谢(Proline metabolism)等生物学过程.因此,诱变改变了苜蓿DNA甲基化水平,为诱变突变体的筛选提供了丰富材料.
文献关键词：
紫花苜蓿;DNA甲基化;重亚硫酸盐测序;表观遗传
中图分类号：
作者姓名：
申晓慧
作者机构：
宜春学院,生命科学与资源环境学院,江西宜春336000
文献出处：
引用格式：
[1]申晓慧-.两种诱变处理下紫花苜蓿全基因组DNA甲基化图谱分析)[J].草地学报,2022(01):46-54
A类：
mCG,mCHH,mCHG
B类：
诱变,紫花苜蓿,全基因组,图谱分析,表观遗传学,甲基磺酸乙酯,重亚硫酸盐测序,BS,seq,EMS,DMR,通路富集分析,氮代谢,代谢通路,Nitrogen,metabolism,蔗糖代谢,糖代谢途径,Starch,sucrose,脯氨酸代谢,Proline,生物学过程,甲基化水平,突变体
AB值：
0.232124
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