典型文献
调控鸡黑色素生成相关基因共表达网络的构建
文献摘要：
为了挖掘与鸡黑色素生成有关的基因,研究通过对NCBI网站公布的12份惠阳髯毛鸡羽毛毛囊的转录组数据进行了基因差异表达分析,并结合黑色素生成相关通路中的基因构建了共表达网络.结果显示:共筛选出了 74个差异基因和100个通路基因用于权重基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA),在分析得到的5个模块中,青色模块与羽色表型显著相关(R=0.94,P＜0.01).对该模块进行hub基因挖掘,共获得16个hub基因.对该模块进行GO,KEGG富集分析,发现被显著富集的αMSH/MClR,WNT/β-catenin信号通路参与了黑色素生成的调控.综合基因差异表达,WGCNA,GO和KEGG多种分析方法,筛选出基因WNT1在黑色素生成中起关键作用.
文献关键词：
鸡;黑色素;WGCNA;hub基因
中图分类号：
作者姓名：
周泽宇;张夕霏;孟婕;张传生;李祥龙;耿立英
作者机构：
河北科技师范学院河北省特色动物种质资源挖掘与创新重点实验室,河北秦皇岛,066004
文献出处：
引用格式：
[1]周泽宇;张夕霏;孟婕;张传生;李祥龙;耿立英-.调控鸡黑色素生成相关基因共表达网络的构建)[J].河北科技师范学院学报,2022(04):39-46
A类：
MClR
B类：
黑色素生成,NCBI,惠阳,羽毛,毛毛,毛囊,转录组数据,基因差异表达,差异表达分析,相关通路,差异基因,路基,权重基因共表达网络分析,Weighted,Gene,Co,expression,Network,Analysis,WGCNA,青色,羽色,hub,基因挖掘,共获,富集分析,MSH,catenin,WNT1
AB值：
0.355393
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