典型文献
基于芯片筛选螺原体感染中华绒螯蟹血细胞的免疫microRNAs
文献摘要：
为筛选分析螺原体(Spiroplasma eriocheiris)感染中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)血细胞免疫相关microRNAs(miRNA)及其差异表达情况,利用微流体芯片技术,对正常和感染螺原体的中华绒螯蟹血细胞miRNA进行系统的鉴定与表达检测;结合生物信息学方法,分析其靶基因和免疫信号通路.利用前期研究和已有报道897条成熟miRNA作为探针订制单色芯片,使用Cy3染料标记,通过与中华绒螯蟹血细胞总RNA样本杂交,鉴定miRNA,检测其表达情况;对差异表达的miRNA进行靶基因预测、功能聚类和通路分析;随机挑选部分差异表达的miRNA进行茎环RT-qPCR验证.结果显示,总共鉴定出中华绒螯蟹血细胞miRNA共303个;健康组和试验组共表达miRNA有48个;差异表达miRNA为27个,其靶基因共注释到116个GO和63个KEGG通路;通过茎环RT-qPCR检测,结果与芯片基本一致.研究发现,差异表达miRNA靶基因,许多均存在于重要免疫信号通路之中,研究结果可为进一步分析中华绒螯蟹血细胞螺原体感染中的miRNA与其靶基因间的免疫调控机制提供借鉴.
文献关键词：
中华绒螯蟹;螺原体;microRNA;微流体芯片
中图分类号：
作者姓名：
欧江涛;蒋启程;周刻焱;柳巧;栾筱琪;王资生;张启焕
作者机构：
盐城工学院海洋与生物工程学院,江苏盐城224051
文献出处：
引用格式：
[1]欧江涛;蒋启程;周刻焱;柳巧;栾筱琪;王资生;张启焕-.基于芯片筛选螺原体感染中华绒螯蟹血细胞的免疫microRNAs)[J].江苏农业科学,2022(17):46-52
A类：
eriocheiris
B类：
螺原体,中华绒螯蟹,血细胞,microRNAs,Spiroplasma,Eriocheir,sinensis,细胞免疫,免疫相关,miRNA,差异表达,利用微,微流体芯片,芯片技术,生物信息学方法,免疫信号通路,前期研究,订制,制单,单色,Cy3,染料,靶基因预测,通路分析,qPCR,总共,共表达,片基,免疫调控,调控机制
AB值：
0.298411
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