典型文献
连翘ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析
文献摘要：
本研究基于连翘[Forsythia suspensa(Thunb.)Vahl]基因组鉴定了连翘ARF(Auxin Response Factor)基因家族成员,并对FsARF基因进行生物信息学分析与功能预测.利用生物信息学的方法,对FsARF基因家族成员的基本性质、染色体定位、进化树、基因结构、结构域、顺式作用元件、不同组织表达模式进行分析.共鉴定出35个FsARF基因(FsARF1-35),它们在染色体上均有分布,其中3个分别分布在未挂载的片段,FsARF基因可分为5个亚族.35个ARF基因编码的蛋白质由326～1086 aa组成,连翘ARF基因编码的35个蛋白均为亲水性蛋白,其亚细胞定位在细胞核内.FsARF蛋白的二级结构主要由无规则卷曲构成.35个FsARF蛋白均含有DBD、Auxin_resp结构域,其中20个含有CTD结构域.35个FsARF基因启动子顺式作用元件与植物激素、生长发育、防御与胁迫、次级代谢产物合成相关.FsARF基因在不同组织部位差异表达.FsARF基因在植物生长发育过程中、应对激素与非生物胁迫时起着重要调控作用,其中FsARF2可能对花生长发育,FsARF6、FsARF14对果实发育起着重要调控作用.
文献关键词：
连翘;ARF基因家族;蛋白结构域;基因组
中图分类号：
作者姓名：
栗谦;王帆;王淑晨;吴琼;杨雅琳;袁王俊;李永
作者机构：
河南农业大学林学院,河南郑州 450002;河南大学药学院,河南开封 475001;河南农业大学风景园林与艺术学院,河南郑州 450002
文献出处：
引用格式：
[1]栗谦;王帆;王淑晨;吴琼;杨雅琳;袁王俊;李永-.连翘ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析)[J].石河子大学学报（自然科学版）,2022(06):719-728
A类：
FsARF,FsARF1,FsARF2,FsARF6,FsARF14
B类：
连翘,基因家族,生物信息学分析,于连,Forsythia,suspensa,Thunb,Vahl,Auxin,Response,Factor,功能预测,利用生物,基本性质,染色体定位,进化树,基因结构,顺式作用元件,不同组织,组织表达模式,挂载,基因编码,aa,亲水性,亚细胞定位,细胞核,二级结构,无规则,卷曲,DBD,resp,CTD,基因启动子,植物激素,次级代谢产物,产物合成,组织部位,位差,差异表达,植物生长发育,非生物胁迫,花生,果实发育,蛋白结构域
AB值：
0.316371
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