典型文献
马铃薯VQ基因家族鉴定与表达分析
文献摘要：
VQ蛋白是一类具有"FxxxVQxLTG"保守氨基酸序列的植物非特异性蛋白,由于其序列中含有2个高度保守的二肽缬氨酸(valine)和谷氨酰胺(glutamine),故称VQ蛋白.该家族在植物生长发育和胁迫响应中发挥着重要作用,但在马铃薯(Solanum tuberosum)中研究较少.为探讨马铃薯VQ家族功能,本研究采用生物信息学方法对StVQ基因家族成员的基本特征进行了分析,并使用qPCR方法验证了其对多种胁迫的响应情况.结果显示:StVQ家族共有37个成员,命名为:StVQ1～StVQ37,依次分布在马铃薯的12条染色体上,其中的34个成员序列中不含有内含子;依照序列特征可将该家族分为9个亚家族;多序列比对结果显示StVQ家族蛋白存在7种变异类型.种内共线性分析共发现了 1对串联重复基因和7对片段重复基因,对蛋白网络预测分析推断其与StWRKY存在互作,RNA-seq数据则显示StVQ基因在马铃薯的不同组织表达有差异,而且在不同胁迫下的表达量变化也不同.进一步的qPCR和启动子分析证实这些基因能够响应冷、盐或干旱等多种非生物胁迫.本研究结果为更深层次的StVQ功能验证和作用机理分析提供参考.
文献关键词：
马铃薯;VQ基因家族;表达模式;非生物胁迫
中图分类号：
作者姓名：
翟明明;刘娜;徐任园;李欢欢;王倩;刘柏林;汪奎;方玉川;郭东伟
作者机构：
西北农林科技大学农学院,杨凌712100;陕西省榆林市农业科学院 榆林719000
文献出处：
引用格式：
[1]翟明明;刘娜;徐任园;李欢欢;王倩;刘柏林;汪奎;方玉川;郭东伟-.马铃薯VQ基因家族鉴定与表达分析)[J].农业生物技术学报,2022(01):25-37
A类：
FxxxVQxLTG,StVQ,StVQ1,StVQ37,StWRKY
B类：
马铃薯,基因家族鉴定,表达分析,氨基酸序列,非特异性,二肽,缬氨酸,valine,谷氨酰胺,glutamine,植物生长发育,胁迫响应,Solanum,tuberosum,中研,生物信息学方法,qPCR,方法验证,内含子,序列特征,亚家族,多序列比对,变异类型,种内,共线性分析,串联重复基因,蛋白网络,预测分析,seq,不同组织,组织表达,启动子分析,够响,非生物胁迫,功能验证,机理分析,表达模式
AB值：
0.301365
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
