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典型文献
'麦缘锦楸'叶色表型qRT-PCR内参基因筛选及验证
文献摘要:
[目的]筛选不同叶色部位稳定表达的内参基因,为后期开展'麦缘锦楸'叶色形成的分子机制奠定基础.[方法]以'麦缘锦楸'不同叶色部位及灰楸对应部位叶片为材料,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了7个候选基因(CfUBC、CfActin11、CfPP2A、CfMADH、CfGADPH、CfEF-1及CbuActin)的相对表达量,利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper等分析软件对内参基因进行了稳定性评价.分析了'麦缘锦楸'和灰楸不同叶色部位中萜类合成相关基因(CfGES)的表达模式,验证了上述稳定性评价结果的可靠性.[结果]7个候选内参基因在'麦缘锦楸'和灰楸叶片中均具有作为内参基因的性能,其中,CfMADH和CfEF-1在不同叶色部位的表达量最稳定,CfGADPH和CfActin11次之,CfUBC最差.以萜类合成相关基因CfGES验证内参稳定性发现,单独或组合使用CfEF-1及CfMADH为内参基因时,CfGES的表达差异与转录组数据趋势一致.[结论]单独或组合使用CfMADH和CfEF-1来校准'麦缘锦楸'不同叶色部位的基因表达量,可显著提高实验结果的可靠性.
文献关键词:
’麦缘锦楸’;叶片;内参基因;qRT-PCR
作者姓名:
杨英英;赵林姣;杨桂娟;张玉;付鹏跃;胡继文;刘莹;王楠
作者机构:
三峡大学生物技术研究中心, 湖北 宜昌 443002;林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业和草原局林木培育重点实验室, 楸树国家创新联盟, 北京 100091;西南林业大学林学院, 云南 昆明 650224;东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室, 黑龙江 哈尔滨 150040
文献出处:
引用格式:
[1]杨英英;赵林姣;杨桂娟;张玉;付鹏跃;胡继文;刘莹;王楠-.'麦缘锦楸'叶色表型qRT-PCR内参基因筛选及验证)[J].林业科学研究,2022(01):123-131
A类:
CfUBC,CfActin11,CfPP2A,CfMADH,CfGADPH,CfEF,CbuActin,CfGES
B类:
叶色表型,qRT,内参基因,基因筛选,稳定表达,灰楸,候选基因,相对表达量,GeNorm,NormFinder,BestKeeper,稳定性评价,萜类合成,表达模式,因时,表达差异,转录组数据,来校,基因表达量,高实
AB值:
0.182696
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