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典型文献
生物信息学分析SLC10A1在肝细胞癌的临床意义和作用机制
文献摘要:
目的 探讨溶质载体家族10成员1(SLC10A1)在肝细胞癌(HCC)中的表达、作用机制及免疫浸润特征.方法 利用肿瘤和癌症基因组图谱数据库和高通量基因表达数据库中的HCC数据信息,分析SLC10A1的表达与HCC临床病理特征、生存期之间的关系,Western blotting验证其在HCC组织中的表达水平;利用"DESeq2"差异表达分析和基因集富集分析探讨其潜在作用机制;TISIDB和TIMER数据库用于免疫浸润分析.结果 SLC10A1在HCC中显著低表达,低表达SLC10A1的HCC患者总体生存期、疾病特异性生存期和无进展生存期更短,临床预后不良.组成型雄烷受体通路、硫氨基酸代谢、过氧化物酶体脂质代谢和脂肪酸Ω氧化等胆汁酸代谢相关通路是SLC10A1参与HCC进展的潜在机制.SLC10A1表达与细胞毒性T细胞、辅助型T细胞1、辅助型T细胞2、滤泡辅助性T细胞和巨噬细胞浸润呈负相关关系.结论 SLC10A1在HCC中低表达,其表达降低致使HCC患者预后差、复发率高,胆汁酸代谢相关通路失调、免疫逃逸促进可能是SLC10A1参与HCC发生发展的关键途径.
文献关键词:
溶质载体家族10成员1;肝细胞癌;预后;免疫浸润;生物信息学
作者姓名:
李婧;姜文凯;周瑞丽;张海涛;马智慧;白仲添
作者机构:
兰州大学 第一临床医学院,甘肃 兰州 730000;兰州大学 第二临床医学院,甘肃 兰州 730000;兰州大学 信息科学与工程学院,甘肃 兰州 730000;数学与统计学院,甘肃 兰州 730000;兰州大学第一医院 普通外科,甘肃 兰州 730000;兰州大学第一医院 甘肃省生物治疗与再生医学重点实验室,甘肃 兰州 730000
引用格式:
[1]李婧;姜文凯;周瑞丽;张海涛;马智慧;白仲添-.生物信息学分析SLC10A1在肝细胞癌的临床意义和作用机制)[J].兰州大学学报(医学版),2022(11):63-70
A类:
组成型雄烷受体
B类:
生物信息学分析,SLC10A1,肝细胞癌,意义和作用,溶质载体,HCC,免疫浸润,癌症基因组图谱数据库,高通量基因表达数据库,临床病理特征,blotting,DESeq2,差异表达分析,基因集富集分析,潜在作用,TISIDB,TIMER,低表达,总体生存期,疾病特异性生存期,无进展生存期,临床预后,预后不良,氨基酸代谢,过氧化物酶体,体脂,脂质代谢,胆汁酸代谢,相关通路,潜在机制,细胞毒性,滤泡,辅助性,巨噬细胞浸润,免疫逃逸
AB值:
0.260769
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