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典型文献
谷胱甘肽过氧化物酶家族与肾细胞癌患者生存预后的关系
文献摘要:
目的:肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是临床高发的肾皮质肿瘤,谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidases,GPXs)基因对RCC的影响及作用机制尚不清楚.本研究旨在通过生物信息学分析探讨GPXs基因在RCC中的表达水平及其对患者预后的影响.方法:下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的公开数据,获取GPXs家族基因mRNA表达数据,采用非参数检验-K多个独立样本检验(Kruskal-Wallis检验)分析RCC患者和正常人群样本中GPXs家族基因的mRNA表达差异;利用UALCAN数据库分析肾透明细胞癌不同患者特征样本与正常人群样本中GPXs家族基因的蛋白质表达差异,评估GPXs家族基因在RCC中的作用;采用Kaplan-Meier Plotter在线分析不同类型RCC与总生存期(overall survival,OS)、无疾病生存期(disease-free survival,DFS)、疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)和无进展生存期(progression-free survival,PFS)的关系,根据GPX8基因表达水平绘制Kaplan-Meier生存曲线进一步研究GPX8基因表达水平与RCC患者预后的关系,基于多因素Cox回归分析结果,引入筛选的GPX8基因建立RCC的Nomogram列线图预测评分模型.结果:GPXs家族中GPX1、GPX4 mRNA在肾嫌色细胞癌、肾透明细胞癌和肾乳头状细胞癌患者中均显著高表达(均P<0.01),GPX7和GPX8在肾乳头状细胞癌和肾透明细胞癌患者中均显著高表达(均P<0.01);与正常人群组相比,肾透明细胞癌人群样本GPX1、GPX2、GPX7、GPX8的蛋白质表达水平均显著升高(均P<0.01),GPX3、GPX4的蛋白质表达均显著降低(均P<0.01),在肾透明细胞癌不同肿瘤分级患者样本中GPX1、GPX2、GPX7、GPX8的蛋白质表达水平均显著提高(均P<0.01),GPX3、GPX4的蛋白质表达均显著降低(均P<0.01).生存分析结果显示:与肾乳头细胞癌和肾嫌色细胞癌相比,肾透明细胞癌患者的OS、DFS、DSS和PFS均缩短;根据GPX8的表达水平将患者分为低、中、高表达组,与GPX8低表达组相比,高表达组RCC患者OS(P<0.01)、DFS(P=0.03)、DDS(P<0.01)和PFS(P=3.18×10?7)均显著缩短;单因素Cox比例回归分析显示GPX8高表达与3种类型RCC的不良OS相关;多因素分析显示GPX8是影响肾乳头状细胞癌患者OS的独立因素,种族、肿瘤原发灶淋巴结远处转移(post tumor node metastasis,pTNM)分型是影响肾透明细胞癌OS的独立因素,GPX8、pTNM分型是影响肾嫌色细胞癌患者OS的独立因素.构建3种类型细胞癌患者OS列线图风险模型,采用一致性指数(consistency index,C-index)和校准曲线对模型的判别和校准进行评价,肾乳头状细胞癌患者列线图风险模型C-index为0.62(95%CI:0.51~1.00,P=0.03),受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析结果显示曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.88.肾透明细胞癌患者列线图风险模型C-index为0.72(95%CI:0.52~1.00,P=0.03),AUC为0.90.肾嫌色细胞癌患者列线图风险模型C-index为0.90(95%CI:0.85~1.00,P<0.01),AUC为0.59.结论:GPXs家族基因特别是GPX8是RCC不良预后的潜在标志物,可通过GPXs家族基因的表达情况在临床实践中预测RCC的发生和发展.
文献关键词:
肾细胞癌;谷胱甘肽过氧化物酶;预后;列线图
作者姓名:
李娟;霍生杰;张荣强;史传道;孙娜;刘启玲
作者机构:
陕西中医药大学公共卫生学院,陕西咸阳712046;陕西中医药大学第二附属医院神经外科,陕西咸阳712046
引用格式:
[1]李娟;霍生杰;张荣强;史传道;孙娜;刘启玲-.谷胱甘肽过氧化物酶家族与肾细胞癌患者生存预后的关系)[J].中南大学学报(医学版),2022(05):562-572
A类:
B类:
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AB值:
0.245764
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