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典型文献
绿鳍马面鲀微卫星标记开发及在丝背细鳞鲀中的通用性检测
文献摘要:
为充分挖掘绿鳍马面鲀(Thamnaconus modestus)基因组资源,开发可用于群体遗传学研究的分子标记,本研究利用NCBI数据库中公布的绿鳍马面鲀全基因组序列筛查微卫星位点并在野生群体中验证,在85个选取的位点中筛选得到30个新的多态性较高的微卫星标记.每个微卫星标记的等位基因数为4~16,平均为8.5个;观测杂合度范围为0.207~0.916,平均值为0.685;期望杂合度范围为0.315~0.971,平均值为0.756;多态信息含量范围为0.301~0.898,平均值为0.716,其中属于高度多态的位点有26个,占总位点数的86.67%;经过Bonferroni校正后,有7个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡.将30个绿鳍马面鲀多态性微卫星标记在丝背细鳞鲀(Stephanolepis cirrhifer)中进行通用性检测,其中13个位点成功扩增,9个位点具有多态性.本研究开发的微卫星标记可用于绿鳍马面鲀及相关物种的遗传多样性分析、QTL定位以及系统进化等研究.
文献关键词:
绿鳍马面鲀(Thamnaconus modestus);丝背细鳞鲀(Stephanolepis cirrhifer);微卫星标记;通用性
作者姓名:
王九龙;徐文刚;杨沛;杨婕;杜荣斌;刘立明
作者机构:
烟台大学 海洋学院, 山东 烟台 264005
文献出处:
引用格式:
[1]王九龙;徐文刚;杨沛;杨婕;杜荣斌;刘立明-.绿鳍马面鲀微卫星标记开发及在丝背细鳞鲀中的通用性检测)[J].海洋科学,2022(06):99-108
A类:
Stephanolepis,cirrhifer
B类:
绿鳍马面鲀,微卫星标记,标记开发,通用性,Thamnaconus,modestus,群体遗传学,遗传学研究,分子标记,研究利用,NCBI,全基因组序列,星位,在野,野生群体,点中,选得,多态性,等位基因,杂合度,多态信息含量,Bonferroni,个位,Hardy,Weinberg,研究开发,遗传多样性分析,QTL,系统进化
AB值:
0.28964
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