典型文献
基于简化基因组测序的三门湾海域无脊椎动物的遗传多样性分析
文献摘要:
本研究通过简化基因组测序(2b-RAD)技术,对浙江省三门湾海域定居性优势无脊椎动物(哈氏仿对虾、口虾蛄、脊尾白虾、三疣梭子蟹、曼氏无针乌贼、棒锥螺和牡蛎)进行遗传结构和遗传多样性分析,以评估三门湾海域水生无脊椎动物资源现状,并为渔业可持续发展提供物种遗传资源监测依据.7个物种共获得12336~108139个SNP位点,变异位点比例为0.168%~1.571%.遗传分析结果显示,7个物种的平均核苷酸多样性(Pi)为0.147~0.306,平均观测杂合度(Ho)为0.142~0.289,多态信息含量(Polymorphism Information Content,PIC)为0.124~0.234,个体间平均遗传距离为0.118~0.246.本研究表明,三门湾水域7种代表性无脊椎动物中,生物群体变异位点比例较低,遗传多样性水平较低,且相同种群个体间的遗传分化较小,结合本次对三门湾海域渔业资源调查分析,这可能与人工增殖放流等因素有关.
文献关键词:
无脊椎动物;简化基因组测序;SNP;遗传多样性
中图分类号:
作者姓名:
常雪晴;黄伟;李卓卿;王星火;马路阔;王有基
作者机构:
上海海洋大学海洋生物科学国际联合研究中心中国科学技术部,上海201306;上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海201306;自然资源部第二海洋研究所国家海洋局海洋生态系统与生物地球化学重点实验室,浙江杭州310012
文献出处:
引用格式:
[1]常雪晴;黄伟;李卓卿;王星火;马路阔;王有基-.基于简化基因组测序的三门湾海域无脊椎动物的遗传多样性分析)[J].海洋环境科学,2022(02):267-271
A类:
B类:
简化基因组测序,三门湾,海域,无脊椎动物,遗传多样性分析,2b,RAD,定居,哈氏仿对虾,口虾蛄,脊尾白虾,三疣梭子蟹,曼氏无针乌贼,牡蛎,遗传结构,动物资源,资源现状,遗传资源,资源监测,共获,SNP,变异位点,遗传分析,核苷酸多样性,Pi,杂合度,Ho,多态信息含量,Polymorphism,Information,Content,PIC,遗传距离,水域,生物群,遗传分化,渔业资源调查,增殖放流
AB值:
0.332839
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