典型文献
基于转录组西施舌微卫星标记开发及隐种鉴定
文献摘要：
近10年的遗传研究表明,我国沿海西施舌可分为2个隐种,即北方西施舌和南方西施舌.为辅助鉴别这2种西施舌以及准确评估其种质资源,以转录组数据为基础,分别挖掘并分析这2种西施舌转录组上的微卫星序列以及直系同源基因上的微卫星序列,并随机选取4组直系同源基因上的微卫星进行试验验证.结果表明,北方西施舌每16.6个unigene含有1个微卫星,出现频率为6.0％,含63种重复基元.南方西施舌每10.5个unigene含有1个微卫星,出现频率为8.2％,含89种重复基元.在2个隐种的转录组中,除单碱基重复外,优势重复类型均为三碱基重复.在北方西施舌和南方西施舌的转录组中,三碱基重复的优势基元分别为AAC/GTT和ATC/ATG,最常见的微卫星长度均为15 bp.在2个隐种的转录组中,微卫星的重复次数主要为5～10次.有409组直系同源基因在2个隐种中所含微卫星序列长度不同,可以作为潜在的物种特异性分子标记.验证结果表明,4对荧光标记微卫星引物的PCR扩增产物清晰、明确,无杂峰,组合使用2对引物可以初步区分北方西施舌和南方西施舌.
文献关键词：
西施舌;微卫星标记;转录组;直系同源基因;物种鉴定
中图分类号：
作者姓名：
王雨吉;孟学平;易乐飞
作者机构：
江苏海洋大学 海洋科学与水产学院,江苏 连云港 222005
文献出处：
引用格式：
[1]王雨吉;孟学平;易乐飞-.基于转录组西施舌微卫星标记开发及隐种鉴定)[J].水产科学,2022(02):289-295
A类：
B类：
西施舌,微卫星标记,标记开发,遗传研究,海西,方西,种质资源,转录组数据,微卫星序列,直系同源基因,unigene,基元,碱基,重复类型,AAC,GTT,ATC,ATG,bp,复次,所含,分子标记,荧光标记,引物,扩增产物,物种鉴定
AB值：
0.195384
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