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典型文献
长吻单核苷酸多态性标记与生长性状关联分析
文献摘要:
为开发长吻(Leiocassis longirostris)生长性状相关的分子标记,为其分子辅助育种提供基础资料,以115尾长吻为研究对象,运用57个单核苷酸多态性标记(SNPs)位点与体重、全长、体长和头高进行关联分析.结果显示,有10个SNPs位点与生长性状显著相关,其中3个SNPs位点(Cluster-65_137265、Cluster-65_111833 和 Cluster-65_137642)对所测量的 4 个生长性状均有显著影响(P<0.05);3 个 SNPs 位点(Cluster-65_120392、Cluster-65_5592_0 和 Cluster-65_105077)对体重、全长和体长有显著影响(P<0.05);Cluster-65_110382对全长、体长和头高有显著影响(P<0.05);Cluster-65_19497和Cluster-24304_1 对全长和体长有显著影响(P<0.05);Cluster-65_130153 对体长和头高有显著影响(P<0.05).此外,Cluster-65_137265、Cluster-65_111833、Cluster-65_110382 和Cluster-65_137642分别与阴离子交换蛋白 2 样亚型 X1(anion exchange protein 2-like isoform X1)神经突起导向因子4样(netrin-4-like)、酪氨酸蛋白激酶Tec 亚型 X2(tyrosine-protein kinase Tec isoform X2)和氨甲酰磷酸合成酶 1(carbamoyl-phosphate synthase[ammonia],mitochondrial,CPS 1)相似度最高,表明这4个基因可能参与调控了长吻的生长.对与生长相关的10个SNPs位点进行多态性检测,平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.537和0.467,平均多态信息含量为0.357.本研究为长吻的遗传改良和选择育种提供了基础资料,并首次发现了 4个可能与长吻生长相关的基因.
文献关键词:
长吻;SNP;生长性状;关联分析
作者姓名:
李哲;李雨;敬庭森;刘小莉;闫卉果;陆安帅;周剑;罗辉;叶华
作者机构:
西南大学水产学院 重庆 402460;四川省水产研究所 四川 成都 611731
文献出处:
引用格式:
[1]李哲;李雨;敬庭森;刘小莉;闫卉果;陆安帅;周剑;罗辉;叶华-.长吻单核苷酸多态性标记与生长性状关联分析)[J].渔业科学进展,2022(04):127-135
A类:
B类:
单核苷酸多态性标记,生长性状,性状关联,发长,Leiocassis,longirostris,分子标记,分子辅助育种,基础资料,SNPs,全长,体长,Cluster,阴离子交换,X1,anion,exchange,protein,like,isoform,神经突起,导向因子,netrin,酪氨酸蛋白激酶,Tec,X2,tyrosine,kinase,甲酰,合成酶,carbamoyl,phosphate,synthase,ammonia,mitochondrial,CPS,长相,多态性检测,杂合度,多态信息含量,遗传改良,选择育种
AB值:
0.361731
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