首站-论文投稿智能助手
典型文献
肝细胞癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA预后风险模型的建立与评估
文献摘要:
目的:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库建立肝细胞癌(HCC)的坏死性凋亡相关长链非编码RNA(NRlncRNA)预后风险模型。方法:从TCGA中下载377例HCC患者样本转录组数据和临床资料(包括374个HCC组织和50个癌旁组织),通过对坏死性凋亡相关基因和lncRNA进行共表达分析确定NRlncRNA;筛选两种组织的差异性,用于后续分析。对377例临床资料进行预处理共筛选到合格的343例样本,随机分组为训练集(172例)和测试集(171例)。在训练集中通过单因素Cox、LASSO、多因素Cox分析确定预后风险模型,计算风险评分,按照风险评分的中位值分为高、低风险组;采用Kaplan-Meier法对两组患者进行生存分析,通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线对预后风险模型进行效能评估。在测试集和整个队列进一步验证。分析高、低风险模型组间生物学通路富集和免疫相关功能的差异。两组间比较通过Wilcoxon检验完成。结果:共筛选到362个NRlncRNA,差异分析筛选出85个差异NRlncRNA,最终筛选出6个NRlncRNA组成的预后风险模型,该模型对训练集患者1年、3年和5年的生存预测性能曲线下面积(AUC)值分别为0.833、0.790和0.803;高风险组患者的总生存期明显低于低风险组( P<0.05)。测试集和整个队列中也具有良好的预测效能。进一步分析表明免疫细胞及功能在高、低风险组中存在不同程度的差异。 结论:基于6个NRlncRNA建立预后风险模型可以有效的预测HCC患者的生存预后,风险评分为HCC独立的预后因素。
文献关键词:
肝细胞癌;坏死性凋亡;长链非编码RNA;预后;免疫
作者姓名:
肖俊豪;颜勇;王百林
作者机构:
贵州医科大学临床医学院,贵阳 550000;暨南大学附属广州红十字会医院肝胆外科 510220
引用格式:
[1]肖俊豪;颜勇;王百林-.肝细胞癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA预后风险模型的建立与评估)[J].中华实验外科杂志,2022(12):2443-2446
A类:
NRlncRNA
B类:
肝细胞癌,坏死性凋亡,关长,长链非编码,预后风险模型,肿瘤基因组图谱,TCGA,数据库建立,HCC,下载,转录组数据,癌旁组织,凋亡相关基因,共表达,表达分析,训练集,测试集,Cox,LASSO,计算风险,风险评分,中位值,低风险组,Kaplan,Meier,生存分析,受试者工作特征,效能评估,生物学通路,通路富集,免疫相关,相关功能,Wilcoxon,生存预测,预测性能,性能曲线,高风险组,总生存期,预测效能,免疫细胞,生存预后,预后因素
AB值:
0.253531
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。