典型文献
基于癌症基因组图谱数据库肺腺癌预后风险模型的建立
文献摘要：
目的:构建基于微小RNA(miRNA，miR)表达量的肺腺癌预后列线图风险模型，研究其对肺腺癌患者生存的预测价值。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载获取肺腺癌miRNA表达数据，包括miRNAseq和临床数据。应用R 3.6.2软件中的edgeR包筛选肺腺癌组织和正常肺组织的差异基因，以│logFC│>2，
P<0.05为筛选条件。应用单因素回归分析、LASSO回归分析、多因素Cox回归分析筛选与预后明显相关的miRNAs，建立风险评分(risk score)方程，构建列线图模型。应用内部验证法和图像校准法、受试者工作特征曲线(ROC)评价模型的特异性和敏感性。通过风险评分及生存曲线对患者进行生存分析。分析miRNAs在各种族表达差异。
结果:识别127个差异miRNA，下调16个，上调111个。单因素回归分析得到14个与预后相关的miRNAs，LASSO回归分析得到13个与预后相关的miRNAs(
P<0.05)。多因素回归分析结果显示hsa-miR-1293、hsa-miR-450a-1、hsa-miR-5571、hsa-miR-3189、hsa-miR-490、hsa-miR-142、hsa-miR-31、hsa-miR-548v是显著的预测因素(
P<0.05)。应用这8个miRNA构建列线图模型，Concordance值(0.701)及图像校准显示该列线图预测能力较好。1、3、5年曲线下面积(AUC)为0.721、0.748、0.733。生存分析结果显示高风险组较低风险组生存率低(
P<0.05)，随着风险评分数值的升高，死亡人数增多。KM生存曲线显示hsa-miR-1293、hsa-miR-5571、hsa-miR-490、hsa-miR-142、hsa-miR-31、hsa-miR-548v与肺腺癌生存预后相关(
P<0.05)。另外这8个miRNAs表达种族差异无统计学意义(
P>0.05)。
结论:成功构建基于miRNAs表达预测肺腺癌预后的列线图模型，其预测准确性较高。
文献关键词：
肺腺癌;微小RNA;癌症基因组图谱;预后列线图模型
中图分类号：
作者姓名：
赵丹;牟海军;王显艳;毕红霞;郑红艳;孔维丽;李晶;程薪樾;戴翔宇
作者机构：
齐齐哈尔医学院医学技术学院 161005;齐齐哈尔医学院附属第三医院呼吸与危重症医学科 161006
文献出处：
引用格式：
[1]赵丹;牟海军;王显艳;毕红霞;郑红艳;孔维丽;李晶;程薪樾;戴翔宇-.基于癌症基因组图谱数据库肺腺癌预后风险模型的建立)[J].中华实验外科杂志,2022(12):2471-2474
A类：
miRNAseq,450a,548v,Concordance
B类：
癌症基因组图谱数据库,预后风险模型,列线图风险模型,肺腺癌患者,预测价值,TCGA,下载,临床数据,edgeR,癌组织,肺组织,差异基因,logFC,LASSO,Cox,风险评分,risk,score,内部验证,验证法,和图像,校准法,受试者工作特征曲线,生存曲线,生存分析,表达差异,多因素回归分析,hsa,预测因素,预测能力,高风险组,低风险组,死亡人数,KM,生存预后,种族差异,预测准确性,预后列线图模型
AB值：
0.229325
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
