典型文献
基于免疫相关长链非编码RNA构建肝癌预后模型
文献摘要:
目的:探讨免疫相关长链非编码RNA(lncRNA)预测肝癌(HCC)患者预后生存情况。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)及Imlnc数据库获取与肝癌中差异表达且免疫相关的lncRNAs,构建加权的共表达网络后使用模块挖掘法挖掘肝癌相关模块,从模块中筛选肝癌预后相关的lncRNA。将肝癌患者样本等量分为训练集和测试集,基于训练集数据构建风险评分模型,基于训练集和测试集样本验证模型的有效性,并结合临床特征分析验证模型的稳定性。使用Lasso回归构建预后模型,Kaplan-Meier生存分析对比高低风险组预后、单因素和多因素Cox回归鉴定肝癌预后危险因素。结果:本研究构建了由7个lncRNA构成的肝癌预后模型,根据模型风险评分将患者分为高风险组和低风险组,对肝癌患者1、3、5年生存预测的AUC值分别为0.76、0.68和0.62。高风险组总体生存时间在年龄>60岁[风险比(
HR)=2.432,
P<0.05)、男(
HR=2.383,
P<0.05),女(
HR=2.396,
P<0.05)、肿瘤T1~T2分级(
HR=2.320,
P<0.05)、肿瘤分期Ⅰ期与Ⅱ期(
HR=2.223,
P<0.05),Ⅲ期与Ⅳ期(
HR=2.310,
P<0.05)方面低于低风险组,风险分层分析结果表明模型的风险评分是独立预后指标(
HR=2.243,
P<0.05)。
结论:本研究构建的lncRNAs预后预测模型具有较好可信度和稳定性,表明这些lncRNA在肝癌发生发展中起重要作用。
文献关键词:
长链非编码RNA;免疫;肝癌;预后预测
中图分类号:
作者姓名:
冯济业;吴益峰;吴宗杨;应立平;陶洋;王金波
作者机构:
宁波大学附属人民医院肝胆胰外科 315041;宁波大学附属人民医院病案统计室 315041
文献出处:
引用格式:
[1]冯济业;吴益峰;吴宗杨;应立平;陶洋;王金波-.基于免疫相关长链非编码RNA构建肝癌预后模型)[J].中华实验外科杂志,2022(11):2198-2200
A类:
Imlnc
B类:
免疫相关,关长,长链非编码,预后模型,HCC,预后生存,生存情况,癌症基因组图谱,TCGA,差异表达,lncRNAs,共表达网络,肝癌患者,等量,训练集,测试集,风险评分模型,验证模型,结合临床,临床特征分析,分析验证,Lasso,Kaplan,Meier,生存分析,分析对比,低风险组,Cox,预后危险因素,研究构建,模型风险,高风险组,生存预测,总体生存,生存时间,风险比,肿瘤分期,风险分层,分层分析,预后指标,预后预测模型,可信度
AB值:
0.326074
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