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典型文献
肝细胞癌氧化应激相关长链非编码RNA预后风险模型的建立与验证
文献摘要:
目的:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库建立肝细胞癌(HCC)的氧化应激相关长链非编码RNA(lncRNA)预后风险模型。方法:通过TCGA数据库下载HCC基因表达谱数据和临床信息(374个HCC组织和50个癌旁组织),获取lncRNAs表达数据。从GeneCards网站获取了807个氧化应激相关的基因和lncRNAs进行共表达分析确定氧化应激相关lncRNAs。通过单因素、多因素Cox分析和LASSO回归建立氧化应激相关lncRNAs预后风险模型,并对模型的预测能力进行评估,计算风险评分,根据风险评分中位值将HCC患者分为高、低风险组,分析两组患者生存时间、免疫浸润的差异性;构建列线图以便个性化预测HCC患者预后。两组间比较通过Wilcoxon检验完成。结果:使用Pearson相关分析确定了712个氧化应激相关lncRNAs,进一步分析其差异性,筛选出291个差异表达lncRNAs;研究并确定7个氧化应激相关的lncRNAs用于构建HCC的预后风险模型;受试者工作特征(ROC)曲线对lncRNAs预测模型的1、3、5年的生存预测性能评价曲线下面积(AUC)分别为0.82、0.716和0.70;Kaplan-Meier生存分析显示低风险组患者生存率明显高于高风险组患者( P<0.01);列线图个性化预测HCC患者预后,证实构建的预后模型具有良好的预测能力;研究分析结果表明,免疫细胞和功能在高、低风险组中存在不同程度差异。 结论:成功构建7个氧化应激相关lncRNAs组成的风险预测模型,能有效预测HCC的生存预后。
文献关键词:
肝细胞癌;长链非编码RNA;氧化应激;预后模型
作者姓名:
张建松;肖俊豪;颜勇;王百林
作者机构:
贵州医科大学临床医学院,贵阳 550004;暨南大学附属广州红十字会医院肝胆外科 510220
引用格式:
[1]张建松;肖俊豪;颜勇;王百林-.肝细胞癌氧化应激相关长链非编码RNA预后风险模型的建立与验证)[J].中华实验外科杂志,2022(12):2436-2439
A类:
B类:
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AB值:
0.279407
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