典型文献
先天性心脏病新生儿血浆circRNAs芯片数据的生物信息学分析
文献摘要：
目的 利用高通量检测技术探讨新生儿先天性心脏病(CHD)的发病机制.方法 将CHD新生儿血清与正常健康新生儿血清各3份进行配对分析,用微阵列探针进行环状RNA(circRNAs)检测.结果 共检测到1711个circRNAs,其中差异表达的circRNAs 375个,在CHD新生儿血清中表达上调的circRNAs 115个,下调的circRNAs 260个(FDR>2,P<0.05).通过美国Arraystar公司的微小RNA(miRNA)结合位点预测软件,该研究对每个差异表达的circRNA预测5个高匹配值的miRNA结合位点,375个差异表达的cir-cRNAs预测结合了1546个miRNAs对14个miRNAs的靶基因进行信号通路分析,其中富集总分位于前3位的通路局灶性黏连、肌动蛋白细胞骨架调节、血管平滑肌收缩均与CHD的病理相关.通过hsa_circ_091419/miR-145/mRNA的网络图构建,该研究预测CHD相关的靶基因其34个,包括hsa-miR-145-3p的靶基因IT-GB8.结论 CHD的发病机制可能与circRNA和miRNA的上调或下调及circRNA-miRNA的共表达密切相关,具体涉及多种途径和多种细胞分子生物学过程的调控.
文献关键词：
circRNAs;先天性心脏病;GO分析;信号通路;circRNA/miRNA/mRNA网络
中图分类号：
作者姓名：
潘秋亚;赵静;崔玥;张雯婷;恽琪;郑爱斌;姚圣连;张伟;陈云;顾猛
作者机构：
常州市儿童医院儿科,江苏常州 213003;高邮市中医医院儿科,江苏扬州 225699
文献出处：
引用格式：
[1]潘秋亚;赵静;崔玥;张雯婷;恽琪;郑爱斌;姚圣连;张伟;陈云;顾猛-.先天性心脏病新生儿血浆circRNAs芯片数据的生物信息学分析)[J].检验医学与临床,2022(15):2063-2067
A类：
GB8
B类：
circRNAs,生物信息学分析,高通量检测,技术探讨,新生儿先天性心脏病,CHD,配对分析,微阵列,差异表达,FDR,Arraystar,结合位点,点预测,预测软件,高匹配,miRNAs,靶基因,通路分析,中富,路局,局灶性,黏连,肌动蛋白,细胞骨架,血管平滑肌,肌收缩,病理相关,hsa,网络图,3p,IT,共表达,分子生物学,生物学过程
AB值：
0.28968
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