典型文献
基于转录组测序研究不同海拔生境神农香菊的基因表达差异
文献摘要：
目的 比较神农香菊不同海拔生境的主要生态环境因子差异和基因表达谱差异,研究神农香菊适应不同海拔生境的分子机制.方法 利用WheatA获得海拔相关的主要生态因子如温度和降水等并进行差异统计分析,利用转录组测序获得黄龙堰与宋洛两个不同海拔生境的神农香菊样本的基因表达谱,并基于GO、KEGG等数据库进行基因注释、功能富集分析,获取样本间的差异基因及其关联的代谢通路.结果 光照和温度是影响神农香菊生长发育的最重要的生态因子.不同海拔种植点样本的差异表达基因主要富集到植物激素信号转导、萜类、苯丙素类、不饱和脂肪酸类等次生代谢生物合成途径.其中,参与萜类生物合成途径的相关基因在不同海拔种植样本间显著上调或下调表达.结论 神农香菊可能通过调控萜类关键表达基因如DXS、DXR、HMGCS等的表达适应生境变化.研究结果 为深入研究神农香菊不同海拔适应机制及新品种培育提供数据支撑.
文献关键词：
神农香菊;海拔;转录组;环境因子;基因表达;次生代谢物
中图分类号：
作者姓名：
周春苗;蒋莉萍;董刚强;刘义飞;陈士林;张景景
作者机构：
湖北中医药大学药学院 武汉 430065;安利(中国)植物研发中心 无锡 214115;中国中医科学院中药研究所 北京 100700
文献出处：
引用格式：
[1]周春苗;蒋莉萍;董刚强;刘义飞;陈士林;张景景-.基于转录组测序研究不同海拔生境神农香菊的基因表达差异)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(04):1356-1368
A类：
神农香菊,WheatA,HMGCS
B类：
转录组测序,不同海拔,基因表达差异,生态环境因子,基因表达谱差异,生态因子,黄龙,基因注释,功能富集分析,差异基因,代谢通路,点样,差异表达基因,植物激素,激素信号,信号转导,萜类,苯丙素,不饱和脂肪酸,脂肪酸类,生物合成途径,类生物,DXS,DXR,生境变化,适应机制,新品种培育,次生代谢物
AB值：
0.244219
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