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益肾骨康方对肺癌A549细胞形态及转录组基因表达的影响
文献摘要：
目的:通过益肾骨康方作用后肺癌A549细胞基因的差异表达情况及进行功能分析,探讨益肾骨康方作用于肺癌的分子作用机制奠定实验基础.方法:实验分为对照组和益肾骨康方组,中药作用于A549细胞24 h后,利用扫描电镜观察A549细胞表面形态的变化;利用转录组基因测序,筛选差异表达基因,并通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对差异表达基因进行功能富集分析.利用Cytoscape 3.6.0软件构建差异表达基因蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.结果:扫描电镜结果显示对照组细胞形态正常,饱满,表面有膜皱,丝状伪足.益肾骨康方组可见细胞表面膜皱显著减少,丝状伪足断裂,凋亡小体形成.差异基因筛选|log2FoldChange|>1的差异表达基因有440个,其中下调基因有136个,上调基因有304个.其中与癌症密切相关的基因为SOX2,在给药组中表达下调.在GO功能富集过程中共得到307条结果,主要涉及生物过程(237项)、细胞组分(56项)和分子功能(14项).KEGG通路分析,结果显示与益肾骨康方抑制肺癌A549细胞的作用相关机制主要涉及到细胞凋亡方面.通过构建PPI网络,找到与中药干预肺癌增殖和转移相关的2个节点度较高的基因:MMP9和CCL2.与对照组比较益肾骨康方下调了MMP9和CCL2基因的表达.结论:益肾骨康方的抗肿瘤作用机制可能是通过下调SOX2、MMP9和CCL2基因的表达,从而抑制了肺癌A549细胞的增殖和转移能力.
文献关键词：
中药;肺癌;A549细胞;益肾骨康方;扫描电镜;转录组基因测序;生物信息学;核心基因
中图分类号：
作者姓名：
何理玉;杨梦霞;芦殿荣;冯利
作者机构：
中国中医科学院望京医院,北京,100102;国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院,北京,100021
文献出处：
引用格式：
[1]何理玉;杨梦霞;芦殿荣;冯利-.益肾骨康方对肺癌A549细胞形态及转录组基因表达的影响)[J].世界中医药,2022(15):2162-2166
A类：
益肾骨康方,转录组基因测序
B类：
A549,细胞形态,功能分析,分子作用机制,电镜观察,细胞表面,表面形态,差异表达基因,基因本体,京都基因与基因组百科全书,功能富集分析,Cytoscape,软件构建,蛋白质相互作用,PPI,饱满,丝状伪足,表面膜,凋亡小体,差异基因筛选,log2FoldChange,SOX2,药组,富集过程,生物过程,通路分析,相关机制,中药干预,移相,节点度,MMP9,CCL2,抗肿瘤作用机制,细胞的增殖,核心基因
AB值：
0.234762
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