典型文献
高效自动化HD-Marker文库构建流程的建立及评估
文献摘要：
针对HD-Marker(High-throughput,sequencing-based GoldenGate approach)技术应用于育种研究时面临的短时间内快速完成大批量样品基因分型的挑战,本研究基于自动化移液工作站建立了HD-M arker文库自动化构建体系并评估了此方法在文库构建中的可靠性.本研究基于自动化移液工作站建立了HD-M arker文库自动化构建流程,并评估了此方法在文库构建中的可靠性.结果表明扩增产物具有较高均匀性,浓度范围在23.1～38.7 ng/μL之间;90.63％ 的文库可获得清晰文库条带;文库位点捕获效率均在97％ 以上,分型位点比例能达到100％,与标准WGS文库数据相比,位点分型准确性也在97％ ～100％ 之间.此自动化文库构建流程可并行处理96个样品的文库制备,整体运行时间仅为人工操作的1/7.本研究首次实现了标准化的自动化HD-M arker基因分型文库制备,为大规模育种群体的基因分型效率的提高提供依据,并为全基因组选择育种的实施提供了具有实用价值的高效率技术平台.
文献关键词：
自动化移液工作站;HD-M arker;文库构建;基因分型;全基因组选择育种
中图分类号：
[1]
交通运输（U）
/
水路运输（U6）
/
港口工程（U65）
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港口水工建筑物（U656）
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码头（U656.1）
/
码头：按用途分（U656.1+3）
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集装箱码头（U656.1+35）
作者姓名：
杨志辉;吕佳;刘平平;张天琦;黄晓文;倪萍;包振民;王师
作者机构：
中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室,山东 青岛 266003;青岛海洋科学与技术试点国家实验室,海洋生物学与生物技术功能实验室,山东 青岛 266237;青岛海洋科学与技术试点国家实验室,海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东 青岛 266237;中国海洋大学三亚海洋研究院,热带海洋生物种质资源开发与种业工程实验室,海南 三亚 572000
文献出处：
引用格式：
[1]杨志辉;吕佳;刘平平;张天琦;黄晓文;倪萍;包振民;王师-.高效自动化HD-Marker文库构建流程的建立及评估)[J].中国海洋大学学报（自然科学版）,2022(05):66-75
A类：
GoldenGate,自动化移液工作站,arker
B类：
HD,Marker,文库构建,构建流程,High,throughput,sequencing,approach,育种研究,大批量,基因分型,自动化构建,构建体系,扩增产物,高均匀性,条带,WGS,并行处理,文库制备,运行时间,人工操作,育种群体,全基因组选择育种,技术平台
AB值：
0.211251
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