典型文献
大黄鱼肌纤维性状的全基因组关联分析
文献摘要：
为定位肉质相关遗传位点,解析大黄鱼肉质性状的遗传调控机制,并为养殖大黄鱼肉质选育提供基础,实验首次对大黄鱼肌纤维性状进行全基因组关联分析.首先采集一个大黄鱼养殖群体的背部肌肉样本,通过组织切片获得了483尾大黄鱼的肌纤维直径及253尾的肌纤维密度数据.随后用双消化限制性酶切位点相关的DNA测序(ddRAD-seq)法进行基因分型,将获得的25520和25309个高质量单核苷酸多态性(SNPs)位点用于全基因组关联分析(GWAS).最终,在5条染色体上定位到了6个显著位点,并注释到了lpin2、adcyap1、btg1、tcp11l2、lifr、thbs4、gmeb1、slc2a1、myom1和myom2共10个候选基因.对上述候选基因的分析表明,大黄鱼的肉质与肌纤维组成、生长,以及能量代谢有关.本研究首次对大黄鱼肌纤维相关性状进行分析和基因组定位,发现2龄成熟大黄鱼的肌纤维性状间不存在性别差异.此外,lpin2、adcyap1和btg1等基因,以及能量代谢、肌纤维组成和生长等生物学过程可能在决定大黄鱼肌肉的物理特性中发挥作用.研究结果为大黄鱼分子标记辅助选育提供了重要的理论参考,并为后续开展针对养殖群体大黄鱼肉质性状的遗传改良提供了分子工具.
文献关键词：
大黄鱼;肌纤维直径;肌纤维密度;ddRAD-seq;全基因组关联分析
中图分类号：
作者姓名：
何骞;吴怡迪;周志雄;郑文彬;周祉吟;郝帅峰;魏煜麒;濮菲;陈佳;徐鹏
作者机构：
厦门大学海洋与地球学院,福建省海洋生物遗传育种重点实验室,福建 厦门 361102;宁德市富发水产有限公司,大黄鱼育种国家重点实验室,福建 宁德 352130
文献出处：
引用格式：
[1]何骞;吴怡迪;周志雄;郑文彬;周祉吟;郝帅峰;魏煜麒;濮菲;陈佳;徐鹏-.大黄鱼肌纤维性状的全基因组关联分析)[J].水产学报,2022(08):1313-1323
A类：
lpin2,adcyap1,btg1,tcp11l2,lifr,thbs4,gmeb1,slc2a1,myom1,myom2
B类：
全基因组关联分析,遗传位点,鱼肉,肉质性状,遗传调控,调控机制,养殖大黄鱼,大黄鱼养殖,养殖群体,背部,肉样,组织切片,肌纤维直径,肌纤维密度,限制性,酶切位点,ddRAD,seq,基因分型,单核苷酸多态性,SNPs,GWAS,候选基因,纤维组成,能量代谢,相关性状,熟大黄,不存在性,性别差异,生物学过程,物理特性,分子标记辅助选育,遗传改良
AB值：
0.195019
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