典型文献
基于虚拟筛选方法从化合物数据库中筛选SARS-COV-2的2'-O-甲基转移酶抑制剂
文献摘要：
由SARS-CoV-2病毒引起的新型冠状病毒肺炎COVID-19对世界各国的日常生活和卫生保健系统造成了前所未有的冲击,治疗该疾病的特效药仍在紧张的研制中.2'-O-甲基转移酶(nsp16)催化了SARS-COV-2的RNA"加帽"反应,是维持该病毒RNA稳定性的重要步骤,因此通过筛选nsp16的抑制剂,干扰SARS-COV-2的稳定性,具有一定的药物开发价值.Sinefungin是一种泛甲基转移酶抑制剂,对nsp16具有较好的抑制效果,被用作本文抑制剂筛选的阳性对照.首先依据RMSD值对分子动力学模拟过程中产生的nsp16-Sinefungin结合构象进行聚类分析,构建并优化药效团模型,该模型包含芳香特征R15、氢键供体特征D9、正电特征P14和负电特征N13各一个.随后利用该药效团模型进行小分子数据库筛选、分子对接、MM-GBSA结合自由能计算、分子动力学模拟,并对筛选得到的化合物进行成药性评价,最终得到C1(CAS:1224032-33-0)、C2(CAS:1224020-56-7)、C3(CAS:1224031-61-1)和C7(CAS:1224035-30-6)四个化合物.结果表明四个化合物均可稳定结合于nsp16活性口袋.
文献关键词：
SARS-CoV-2;2’-O-甲基转移酶;药效团;分子动力学;虚拟筛选
中图分类号：
作者姓名：
储晓慧;宋昱;温泽宇;王晓雨;于宗霞
作者机构：
大连大学生命科学与技术学院,辽宁 大连 116622
文献出处：
引用格式：
[1]储晓慧;宋昱;温泽宇;王晓雨;于宗霞-.基于虚拟筛选方法从化合物数据库中筛选SARS-COV-2的2'-O-甲基转移酶抑制剂)[J].化学研究与应用,2022(05):1016-1024
A类：
nsp16,Sinefungin,芳香特征
B类：
虚拟筛选,筛选方法,从化,SARS,甲基转移酶抑制剂,CoV,卫生保健系统,特效药,加帽,过筛,药物开发,开发价值,抑制效果,抑制剂筛选,阳性对照,RMSD,分子动力学模拟,构象,化药,药效团模型,R15,氢键供体,D9,正电,P14,负电,N13,该药,小分子,分子对接,MM,GBSA,结合自由能,自由能计算,选得,成药性,C1,CAS,C2,C3,C7,个化,口袋
AB值：
0.339872
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