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典型文献
苎麻CCRs基因家族3类成员的生化特性与表达差异
文献摘要:
肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素生物合成的关键酶,在植物中多以基因家族形式存在.本研究通过苎麻转录组信息,筛选并克隆了4个苎麻CCR基因家族成员(BnCCR、BnCCR-1、BnCCR-2和BnCCR-3).序列分析结果发现4个BnCCRs可以分为3类,BnCCR属于bona fide CCR类群,BnCCR-1为CCR类似蛋白,而BnCCR-2和BnCCR-3序列在NADPH结合功能域、催化三联体以及CCR底物结合位点上均与bona fide CCR都有差异,形成了苎麻中一个新的CCR类群.跨膜结构分析显示,BnCCR含有1个跨膜螺旋区,其他3个BnCCRse无跨膜螺旋区.结构分析显示,4个BnCCRs的二级和三级结构存在差异,BnCCR-2同源建模模板不同于其他3个BnCCRs.时空表达谱分析发现,BnCCR在快速生长期的木质部具有较高表达水平,而BnCCR-2在快速生长期的韧皮部具有非常高的表达水平.体外酶活测定进一步研究发现,BnCCR具有典型的bona fide CCR催化活性和底物适应性,而BnCCR-2的表现不同于典型CCR的底物适应性,对肉桂酰CoA和芥子酰CoA表现出结合特异性.因此,苎麻中BnCCR参与木质素的生物合成,而BnCCR-2是具有不同于典型CCR结构、组织表达和体外生化功能的一个新类群,BnCCR-2可能不参与或并不仅仅参与木质素的生物合成,这为研究CCR蛋白家族的进化提供了新的参考.
文献关键词:
苎麻;肉桂酰辅酶A还原酶;表达差异;催化特异性
作者姓名:
唐映红;刘芳;陈建荣;毛凯权;李辉;万海清
作者机构:
湖南文理学院生命与环境科学学院, 湖南常德 415000;常德市农业生物大分子研究中心, 湖南常德 415000;常德市人工智能与生物医药研究中心, 湖南常德 415000;长沙学院生物与环境工程学院, 湖南长沙 410022
文献出处:
引用格式:
[1]唐映红;刘芳;陈建荣;毛凯权;李辉;万海清-.苎麻CCRs基因家族3类成员的生化特性与表达差异)[J].作物学报,2022(10):2546-2559
A类:
CCRs,BnCCR,BnCCRs,bona,BnCCRse,催化特异性
B类:
苎麻,基因家族,生化特性,表达差异,肉桂酰,辅酶,还原酶,木质素,生物合成,关键酶,转录组,序列分析,fide,NADPH,功能域,三联体,底物,结合位点,膜结构,三级结构,同源建模,时空表达谱,表达谱分析,快速生长期,木质部,韧皮部,酶活测定,催化活性,CoA,芥子,组织表达,外生化,生化功能,新类群,白家
AB值:
0.22254
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