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典型文献
中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆
文献摘要:
[目的]了解中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)BCAT基因家族成员的分布、性质及表达模式.中国辣椒是辣椒的5个主要栽培种之一,果实通常具有由支链酯类形成的浓郁果香.支链氨基酸转氨酶(BCAT,Branched-chain Aminotransferase)负责催化支链氨基酸合成相应2-氧代酸,是催化合成支链酯类的第一步反应酶.[方法]使用生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法对中国辣椒的BCAT基因家族成员进行鉴定、表达分析和克隆.[结果]获得5个BCAT基因家族成员,分别命名为CcBCAT1、CcBCAT2、CcBCAT3、CcBCAT4和CcBCAT5,随后对其进行生物信息学分析并克隆CcBCAT1~CcBCAT4.生物信息学分析显示,这些基因分布于辣椒的4条染色体上,蛋白均为亲水性蛋白,氨基酸长度在184~557 aa,分子量为20.29~89.60 ku,等电点为5.57~8.34.亚细胞定位预测结果显示,CcBCAT1定位于叶绿体和线粒体,其他基因家族成员均位于叶绿体.CcBCATs基因时空表达分析显示,CcBCAT1-4基因具有组织表达特异性,CcBCAT2~CcBCAT4相对表达量随着辣椒的成熟呈现逐步上升的趋势,其中CcBCAT4最为明显、CcBCAT1则相反、CcBCAT5未检测到表达.[结论]明确中国辣椒BCAT基因家族的表达模式,推测CcBCAT4参与辣椒果实相关次生代谢物合成.
文献关键词:
中国辣椒;支链氨基酸;生物信息学;表达特征;基因克隆
作者姓名:
谢炳春;黄俊霖;温松森;李涛;李颖;徐小万;徐晓美;吴智明;衡周
作者机构:
仲恺农业工程学院园艺园林学院,广东 广州 510225;广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广东广州 510640
文献出处:
引用格式:
[1]谢炳春;黄俊霖;温松森;李涛;李颖;徐小万;徐晓美;吴智明;衡周-.中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆)[J].广东农业科学,2022(12):34-43
A类:
BCAT,Aminotransferase,CcBCAT1,CcBCAT2,CcBCAT3,CcBCAT4,CcBCAT5,CcBCATs
B类:
中国辣椒,基因家族鉴定,表达分析,Capsicum,chinense,Jacq,表达模式,栽培种,酯类,浓郁,果香,支链氨基酸,转氨酶,Branched,chain,氨基酸合成,催化合成,第一步,一步反应,生物信息学分析,基因分布,亲水性,aa,分子量,ku,等电点,亚细胞定位,定位预测,叶绿体,因时,时空表达,有组织,组织表达,相对表达量,未检,辣椒果实,实相,次生代谢物,表达特征,基因克隆
AB值:
0.248056
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