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典型文献
甘蓝型油菜phytocyanin家族全基因组鉴定和表达分析
文献摘要:
质体蓝素(phytocyanin,PC)是一类含铜电子转移蛋白,参与植物光合作用、生长发育以及对环境的适应等.为研究异源四倍体作物甘蓝型油菜的PC基因功能,对BnPC家族进行全基因组鉴定,共鉴定到173个成员.根据铜结合位点以及糖基化位点的差异将该基因家族的蛋白划分为4个亚家族:类早期结瘤素蛋白(BnENODL)、类花青苷蛋白(BnUCL)、类漆树蓝蛋白(BnSCL)和类质体蓝素蛋白(BnPLCL).蛋白质序列特征分析结果表明,133个BnPC含有N端信号肽,77个BnPC具有糖基磷脂酰肌醇锚定信号,87个BnPC具有阿拉伯半乳聚糖结构域,104个BnPC具有N-糖基化位点.共线性分析结果表明,基因组复制和片段重复在该家族的扩张中起着重要作用.表达谱分析结果表明,部分BnPC基因的表达具有组织/器官特异性,95个BnPC基因至少对旱、盐、冷和高温胁迫中的一种产生响应.
文献关键词:
甘蓝型油菜;质体蓝素;系统发生分析;表达分析
作者姓名:
张帅;林科运;侯纯朴;方玉洁;王幼平
作者机构:
扬州大学生物科学与技术学院,江苏扬州,225009
引用格式:
[1]张帅;林科运;侯纯朴;方玉洁;王幼平-.甘蓝型油菜phytocyanin家族全基因组鉴定和表达分析)[J].中国油料作物学报,2022(01):116-129
A类:
phytocyanin,质体蓝素,BnPC,结瘤素,BnENODL,BnUCL,BnSCL,BnPLCL
B类:
甘蓝型油菜,全基因组鉴定,表达分析,电子转移,光合作用,究异,异源四倍体,基因功能,结合位点,糖基化位点,基因家族,亚家族,花青苷,漆树,蛋白质序列,序列特征分析,信号肽,糖基磷脂,磷脂酰肌醇,锚定,阿拉伯半乳聚糖,结构域,共线性分析,表达谱分析,有组织,器官特异性,高温胁迫,系统发生分析
AB值:
0.23569
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