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典型文献
两对同卵双胞胎1型神经纤维瘤与骨假关节的基因型与表型分析
文献摘要:
目的:通过对两对患1型神经纤维瘤(neurofibromatosis type 1,NF1)的同卵双胞胎进行全基因组测序分析对比儿童先天性骨假关节(congenital pseudarthrosis,CP)表型和非CP表型患儿的分子特征,鉴定CP患儿的致病变异,并对相关表型和1型神经纤维瘤致病基因 NF1变异进行特征描述。 方法:根据胫骨假关节诊断标准和NF1临床诊断标准,纳入两对均患有NF1的同卵双胞胎,均为女性,且每对双胞胎中均仅1人有CP表型。对两对同卵双胞胎的外周血提取DNA进行全基因组测序,运用生物信息学方法分析单核苷酸变异(single nucleotide variant,SNV)、短插入缺失变异(short insertion deletion variants,InDel)、拷贝数变异(copy number variant,CNV)和结构变异(structural variant,SV),鉴定出涉及 NF1基因的致病变异及CP患者特有的胚系致病变异;对鉴定出的致病变异在双胞胎及父母中进行一代测序验证。 结果:两对NF1型同卵双胞胎中均鉴定到 NF1基因的致病胚系变异,分别为:c.3047_3048del(p.Cys1016SerfsTer4)和c.4267A>G(p.Lys1423Glu)杂合变异;经过家系4人的一代测序验证,表明均为新发变异。除 NF1基因外,在CP患儿特有而未患CP的同胞姐妹没有的变异中,未鉴定到其他致病或可能致病的SNV/InDel、结构变异或CNV变异。进一步比较两对双胞胎中CP患儿特有的评级为意义不明的低频有害错义变异和功能缺失型SNV和InDels变异,发现这些变异共同影响的基因有1 802个,无共同基因存在编码区的变异;评级为意义不明的结构变异或CNV变异所在的基因无交集,即无共同变异基因。 结论:全基因组测序分析揭示两对患有NF1同卵双胞胎均鉴定到了1型神经纤维瘤致病基因 NF1的致病变异,未鉴定到双胞胎中CP患者特有的其他致病变异,且两个CP患者中未检测到其他的共同基因包含可能致病的变异。
文献关键词:
假关节;神经纤维瘤病1型;基因检测;双生;表型
作者姓名:
郑宇;朱光辉;胡正茂;刘尧喜;杨永佳;罗真情;梅海波
作者机构:
湖南省儿童医院,湖南儿科医学研究所,长沙 410007;中南大学生命科学学院医学遗传学研究中心,长沙 410078;湖南省儿童医院骨科,长沙 410007
文献出处:
引用格式:
[1]郑宇;朱光辉;胡正茂;刘尧喜;杨永佳;罗真情;梅海波-.两对同卵双胞胎1型神经纤维瘤与骨假关节的基因型与表型分析)[J].中华骨科杂志,2022(16):1054-1064
A类:
3048del,Cys1016SerfsTer4,4267A,Lys1423Glu
B类:
两对,双胞胎,假关节,基因型与表型,表型分析,neurofibromatosis,type,NF1,全基因组测序分析,分析对比,先天性,congenital,pseudarthrosis,CP,分子特征,致病变异,致病基因,特征描述,胫骨,诊断标准,患有,生物信息学方法,单核苷酸变异,single,nucleotide,SNV,插入缺失,short,insertion,deletion,variants,拷贝数变异,copy,number,CNV,结构变异,structural,SV,胚系,异在,一代测序,杂合变异,家系,新发变异,同胞,胞姐,姐妹,异或,评级,错义变异,InDels,在编,编码区,交集,异基因,未检,神经纤维瘤病,基因检测,双生
AB值:
0.254648
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