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典型文献
基于蛋白质组学对脊柱结核患者外周血浆差异蛋白筛选及功能分析
文献摘要:
目的:利用蛋白质组学技术筛选脊柱结核(spinal tuberculosis,STB)患者外周血浆中表达差异的蛋白质,探讨STB致病机制及代谢途径.方法:收集30例STB患者和30例健康志愿者的外周血,取其中3例STB患者(观察组)和3例健康志愿者(对照组)的外周血浆通过蛋白质组学同位素标记相对及绝对定量技术和液相色谱-质谱分析技术鉴定差异蛋白,筛选出表达差异显著(差异倍数>1.2,P<0.05)的蛋白质,并进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;然后将30例STB患者和30例健康志愿者的血浆进行实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(real-time quan-titative polymerase chain reaction,RT-PCR)和酶联免疫吸附测定法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)验证其差异基因及蛋白.结果:STB患者外周血浆中共筛选出16个与对照组存在显著性差异的蛋白;其中 11 个蛋白[脂多糖蛋白(lipopolysaccharide-binding protein,LBP)、S 100-A8 蛋白(protein S100-A8)AS100-A9 蛋白(protein Sl00-A9)、淀粉样蛋白 A-2(serum amyloid A-2 protein,SAA2)、富含亮氨酸 α-2 糖蛋白(leucine-rich alpha-2-glycoprotein,LRG2)、蛋白聚 糖 4(proteoglycan 4,PRG4)、补体因子 Ⅰ(complement factorⅠ,CFI)、α-1-抗胰蛋白酶(alpha-l-antitrypsin,SERPINAl)、组织蛋白酶 D(cathepsin D,CTSD)、血浆铜蓝蛋白(ceruloplasmin,CP)和 λ免疫球蛋白(lambda-immunoglobulin 4-60,IGLV4-60)]表达上调,5 个蛋白[黏着斑蛋白(vinculin,VCL)、3-64D 免疫球蛋白(immunoglobulin heavy variable 3-64D,IGHV3-64D)、2D-29 免疫球蛋白(immunoglobulin kappa variable 2D-29,1GKV2D-29)、非功能性免疫球蛋白(non-functional immunoglobulin 6D-41,IGKV6D-41)和 1-45 免疫球蛋白(immunoglobulin heavy variable 1-45,1GHV1-45)]表达下调.LBP、S100-A8蛋白和S100-A9蛋白在STB患者外周血浆的基因和蛋白表达与对照组比较均显著性升高(P<0.05),主要参与白介素-17信号通路和自噬信号通路,且在以上信号通路中与炎症、自噬、趋化因子等生物学功能相关.SAA2、LRG2、PRG4、CFI、SERPINA1、CTSD、CP和VCL的基因和蛋白表达与对照组无统计学差异;IGLV4-60、IGHV3-64D、IGKV2D-29、IGKV6D-41和IGHV1-45的基因表达与对照无显著性差异(P>0.05),蛋白表达未验证.结论:蛋白质组学可用于STB患者外周血差异蛋白的筛选及STB发病机制的研究,LBP、S100-A8和Sl00-A9蛋白可能是STB发病相关的重要表达蛋白,主要参与IL-17信号通路和自噬相关信号通路且集中于炎症、自噬、趋化因子等生物学功能.
文献关键词:
脊柱结核;蛋白质组学;差异蛋白;信号通路
作者姓名:
娄才立;马宏宝;任智博;王立楠;张旭;董辉;俞梦楚;牛宁奎
作者机构:
宁夏医科大学临床学院,750004银川市;宁夏医科大学总医院科研设备管理中心,750004银川市;宁夏医科大学总医院脊柱骨科,750004银川市
引用格式:
[1]娄才立;马宏宝;任智博;王立楠;张旭;董辉;俞梦楚;牛宁奎-.基于蛋白质组学对脊柱结核患者外周血浆差异蛋白筛选及功能分析)[J].中国脊柱脊髓杂志,2022(09):814-822
A类:
AS100,Sl00,SAA2,LRG2,PRG4,antitrypsin,SERPINAl,IGLV4,1GKV2D,IGKV6D,1GHV1,IGKV2D,IGHV1
B类:
脊柱结核,结核患者,差异蛋白筛选,功能分析,蛋白质组学技术,技术筛选,spinal,tuberculosis,STB,表达差异,致病机制,代谢途径,健康志愿者,同位素标记,绝对定量,定量技术,质谱分析技术,技术鉴定,出表,倍数,基因本体,gene,ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,富集分析,逆转录聚合酶链反应,real,quan,titative,polymerase,chain,reaction,酶联免疫吸附测定法,enzyme,linked,immunosorbent,assay,差异基因,脂多糖,糖蛋白,lipopolysaccharide,binding,LBP,A8,A9,淀粉样蛋白,serum,amyloid,亮氨酸,leucine,rich,alpha,glycoprotein,proteoglycan,补体因子,complement,CFI,胰蛋白酶,组织蛋白酶,cathepsin,CTSD,血浆铜蓝蛋白,ceruloplasmin,CP,免疫球蛋白,lambda,immunoglobulin,黏着斑,斑蛋白,vinculin,VCL,64D,heavy,variable,IGHV3,kappa,非功能,functional,白介素,自噬,趋化因子,生物学功能,SERPINA1,统计学差异
AB值:
0.292517
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