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典型文献
西里伯斯青鳉tyr和slc24a5的克隆及表达分析
文献摘要:
为了探究黑色素合成相关基因酪氨酸酶(Tyrosinase,tyr)和溶质载体24家族成员5(Solute carrier family 24,member 5,slc24a5)在西里伯斯青鳉(Oryzias celebensis)中的表达特征,研究采用RACEs(Rapid Amplication of cDNA Ends)技术从西里伯斯青鳉精巢中克隆了tyr(Octyr)和slc24a5(Ocslc24a5)的全长cDNA(Complementary DNA).Octyr的cDNA全长为2249 bp,开放阅读框长1635 bp,编码545个氨基酸;Ocslc24a5的cDNA全长为2065 bp,开放阅读框长1542 bp,编码514个氨基酸.氨基酸多重比对和系统发育树分析发现,Octyr和Ocslc24a5氨基酸序列非常保守,均与日本青鳉同源性较高.通过PCR克隆了Octyr和Ocslc24a5的基因组DNA序列,结果发现,Octyr开放阅读框跨越5个外显子,Ocslc24a5开放阅读框跨越8个外显子.荧光定量PCR(qRT-PCR)分析了Octyr和Ocslc24a5在不同组织和不同胚胎发育时期的相对表达水平,结果显示,Octyr和Ocslc24a5在脑、眼、肝、肾、肠、皮肤、卵巢和精巢中均有表达,且均在精巢中表达量最高,其次是眼和脑;Octyr和Ocslc24a5在胚胎发育不同时期均有表达,在胚胎发育到第7天时表达水平均达到最高.利用0.25 mmol/L苯基硫脲(PTU)抑制胚胎黑色素沉积后进行整体原位杂交(WISH)发现,Octyr和Ocslc24a5的表达模式相似,在囊胚期,Octyr和Ocslc24a5在所有胚胎细胞中均有表达;在神经胚期,Octyr和Ocslc24a5主要在背部和卵黄膜中表达;在体节期,Octyr和Ocslc24a5在眼睛、脑和背侧皮肤中表达.以上研究结果说明Octyr和Ocslc24a5可能参与西里伯斯青鳉黑色素的合成,研究为深入了解西里伯斯青鳉黑色素形成的分子机制奠定基础.
文献关键词:
tyr;slc24a5;黑色素;基因表达;西里伯斯青鳉
作者姓名:
马元;仲颖;郭婧;李名友
作者机构:
上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心, 上海 201306;上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306
文献出处:
引用格式:
[1]马元;仲颖;郭婧;李名友-.西里伯斯青鳉tyr和slc24a5的克隆及表达分析)[J].水生生物学报,2022(03):282-291
A类:
西里伯,西里伯斯,西里伯斯青鳉,slc24a5,celebensis,RACEs,Amplication,Octyr,Ocslc24a5
B类:
表达分析,黑色素合成,酪氨酸酶,Tyrosinase,溶质载体,Solute,carrier,family,member,Oryzias,表达特征,Rapid,cDNA,Ends,精巢,巢中,全长,Complementary,bp,开放阅读框,系统发育树分析,氨基酸序列,同源性,外显子,qRT,不同组织,同胚,胚胎发育,发育时期,相对表达,天时,苯基,硫脲,PTU,黑色素沉积,原位杂交,WISH,表达模式,囊胚,背部,卵黄膜,体节,节期,眼睛,背侧
AB值:
0.195624
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