研究通过转录组测序对罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)SSR标记进行了发掘,获得SSR位点18592个.随机选取了63个SSR位点设计引物并利用10个个体进行多态性位点筛选,共获得31个具有多态的SSR标记,利用其中19个SSR标记对全同胞家系群(FS)119尾虾及孟加拉F3代野生群(MJL)199尾虾的群体遗传多样性进行分析,并对SSR位点与体质量性状进行关联性分析.结果表明:FS群体共检测到40个等位基因,平均等位基因数为2.1053,平均观测杂合度0.4525,平均期望杂合度0.3804,平均多态信息含量0.3076,处于中度遗传多态水平;MJL群体共检测到65个等位基因,平均等位基因数为3.4211,平均观测杂合度0.4105,平均期望杂合度0.4496,平均多态信息含量0.3882,处于中度遗传多态水平.19个SSR位点与FS群体体质量没有相关性(P>0.05),而在MJL群体中,4个SSR位点与体质量显著相关(P<0.05).对差异显著的位点进行不同基因型体质量性状的多重比较,MR28位点277/285基因型体质量均值极显著高于277/289和285/285基因型(P<0.01),显著高于285/289、273/289、270/273和285/293基因型(P<0.05);MR32位点266/266和266/270基因型体质量均值显著高于270/270基因型(P<0.05);MR34位点210/214基因型体质量均值显著高于210/210和214/214基因型(P<0.05);MR45位点174/190基因型体质量均值显著高于182/182和182/190基因型(P<0.05).研究结果为罗氏沼虾分子标记辅助育种奠定了基础.

转录组测序;SSR标记;关联分析;体质量;罗氏沼虾

陈雪峰;王春琳;李荣华;顾志敏;徐宾朋;程海华;彭菲

浙江省淡水水产研究所, 国家罗氏沼虾遗传育种中心, 湖州 313001;宁波大学海洋学院, 宁波 315211

水生生物学报

[1]陈雪峰;王春琳;李荣华;顾志敏;徐宾朋;程海华;彭菲-.罗氏沼虾转录组SSR标记筛选及其与体质量相关性分析)[J].水生生物学报,2022(08):1150-1159

MJL,MR28,MR32,MR34,MR45

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