典型文献
黄颡鱼溶酶体酸性脂肪酶基因的cDNA序列、启动子及其转录调控分析
文献摘要：
通过分子结构、组织表达及启动子结构功能分析,探讨黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)溶酶体酸性脂肪酶(Lysosmal acid lipase,lal)基因的分子特征及转录调控,为lal在鱼类脂质代谢和转录水平的调控提供新的视野.实验采用RT-PCR和RACE克隆lal基因的cDNA全长序列,其长度为1802 bp,5′上游启动子长度为2052 bp,其中ORF长度为1197 bp,编码398个氨基酸,理论蛋白分子量大小为45.42 kD,等电点为7.70,含有23个残基的信号肽、5个糖基化位点(Asn35-Ile36-Ser37、Asn101-Thr102-Ser103、Asn273-Met274-Thr275、Asn320-Gln321-Ser322、Lys161-Thr162-Thr163)、3个半胱氨酸(Cys257、Cys265、Cys284)、催化三元体(Ser174、Asp344、His373)、一个"帽子"(Thr205-Val329)和一个"盖子"(Phe233-Leu272)结构域.氨基酸序列对比和系统发育树分析显示,黄颡鱼的lal与斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)亲缘关系最近.组织表达分析显示,lal基因的mRNA在脾脏、肠和精巢表达量最高.黄颡鱼lal启动子上存在Sp1、STAT3、PPARα、FOXO1、PPARγ及HNF4α等转录位点,启动子活性实验表明,–1507 bp/–1016 bp区域负调控启动子活性,–1016 bp/+51 bp区域正调控启动子活性.研究对黄颡鱼溶酶体酸性脂肪酶(lal)基因序列的分子特征进行了解析,有助于了解鱼类lal的结构和功能,为进一步研究鱼类脂质代谢的调控机制奠定基础.
文献关键词：
黄颡鱼;lal;分子特征;组织表达;启动子
中图分类号：
作者姓名：
谌芳;仲崇超;陈姝为;张电光;吕武宏;谭肖英
作者机构：
华中农业大学水产学院,农业农村部淡水生物繁育重点实验室,武汉 430070
文献出处：
引用格式：
[1]谌芳;仲崇超;陈姝为;张电光;吕武宏;谭肖英-.黄颡鱼溶酶体酸性脂肪酶基因的cDNA序列、启动子及其转录调控分析)[J].水生生物学报,2022(01):98-105
A类：
Lysosmal,lal,Asn35,Ile36,Ser37,Asn101,Thr102,Ser103,Asn273,Met274,Thr275,Asn320,Gln321,Ser322,Lys161,Thr162,Thr163,Cys257,Cys265,Cys284,Ser174,Asp344,His373,Thr205,Val329,Phe233,Leu272,+51
B类：
黄颡鱼,溶酶体,脂肪酶,酶基因,cDNA,转录调控,分子结构,结构功能,功能分析,Pelteobagrus,fulvidraco,acid,lipase,分子特征,鱼类,类脂,脂质代谢,转录水平,RACE,全长,bp,子长,ORF,分子量,kD,等电点,残基,信号肽,糖基化位点,帽子,盖子,结构域,氨基酸序列,系统发育树分析,斑点叉尾鮰,Ictalurus,punctatus,亲缘关系,组织表达分析,脾脏,精巢,Sp1,STAT3,PPAR,FOXO1,HNF4,启动子活性,负调控,正调控,基因序列,结构和功能,调控机制
AB值：
0.271748
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