典型文献
山新杨LTP家族基因生物信息学及表达模式分析
文献摘要：
以山新杨(Populus davidiana×P.alba var.pyramidalis)LTP家族基因为研究对象,初步分析该家族基因的序列特征和表达模式,筛选材性和抗性相关PdbLTP基因,为LTP基因的分子调控机制研究及林木遗传改良提供候选基因.通过蛋白性质分析、多序列比对分析、进化树分析初步分析LTP家族基因的序列特征.利用荧光定量PCR(qRT-PCR)分析重力、NaCl及PEG胁迫处理下山新杨LTP家族基因的表达模式.查找获得8条PdbLTP基因序列,2条亚家族PdbGLTP基因序列.CDS序列长度在294～396bp.LTP家族蛋白为疏水性蛋白且具有8个半胱氨酸的保守结构.qRT-PCR结果显示,PdbLTP1、PdbLTP3、PdbLTP5、PdbLTP7基因在应拉木中表达上调;PdbLTP1、PdbLTP2、PdbLTP3、PdbLTP5基因在茎中表达量最高;除PdbLTP5外,其它基因均受盐胁迫诱导;PdbLTP1、PdbLTP2、PdbLTP3、和PdbLTP5受干旱胁迫诱导.PdbLTP基因家族成员在调控山新杨木质部发育和抵抗非生物胁迫中发挥作用.
文献关键词：
山新杨;LTP家族;生物信息学;表达模式分析
中图分类号：
作者姓名：
孙乾;吴宇航;张雅譞;曹竞丹;石晶静;王超
作者机构：
东北林业大学林学院,哈尔滨 150040;东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,哈尔滨 150040
文献出处：
引用格式：
[1]孙乾;吴宇航;张雅譞;曹竞丹;石晶静;王超-.山新杨LTP家族基因生物信息学及表达模式分析)[J].植物研究,2022(02):211-223
A类：
山新杨,PdbLTP,PdbGLTP,396bp,PdbLTP1,PdbLTP3,PdbLTP5,PdbLTP7,PdbLTP2
B类：
家族基因,表达模式分析,Populus,davidiana,alba,var,pyramidalis,初步分析,序列特征,选材,材性,分子调控机制,林木遗传,遗传改良,候选基因,蛋白性质,性质分析,多序列比对,比对分析,进化树分析,qRT,NaCl,PEG,胁迫处理,下山,基因序列,亚家族,CDS,疏水性,应拉木,盐胁迫,干旱胁迫,基因家族,杨木,木质部,抗非,非生物胁迫
AB值：
0.260847
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