典型文献
基于网络药理学和分子对接研究丁香抗流感的作用机制
文献摘要:
目的:探讨丁香抗流感的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和既往文献筛选丁香活性成分.通过数据库SwissTarget Predictiont获得丁香活性成分的相应靶点;采用GeneCards数据库获取流感相关靶点.将二者取交集,获得共同靶点,运用Cytoscape 3.7.2构建"丁香-活性成分-靶点-疾病网络".运用String数据库构建共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI).利用Metascape进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析.用Autodock Vina 1.1.2对丁香活性成分与流感关键蛋白和流感病毒蛋白进行分子对接,并构建其作用网络.结果:从丁香-活性成分-流感靶点-流感网络中获得rhamnazin-3-O-β-D-glucopyranoside、isoquercitrin、quercetin-3-O-β-D-glucuronide、rhamnetin-3-O-β-D-glucuronide-6″-methyl、1,2,3,6-tetra-O-galloylglucose等28个丁香活性成分和MAPKs、TNF、AKT1、TP53、EGFR、CASP3、HSP90AA1等209个丁香治疗流感的靶点.GO富集分析和KEGG富集分析结果显示,丁香治疗流感主要与激活免疫反应,调控酶活性、细胞凋亡、细胞因子等生物过程和调控PI3 K-AKT、MAPK、细胞凋亡、趋化因子、甲型流感等信号通路有关.分子对接作用网络显示28个活性成分可与HA、NA、M2等多个流感病毒蛋白结合.结论:丁香可能通过多成分与多个流感病毒蛋白结合,并作用于多靶点,调控多通路,进而影响炎症反应、免疫应答、细胞凋亡和流感病毒复制,达到治疗流感的作用.
文献关键词:
网络药理学;丁香;分子对接;流感;流感病毒;靶点;通路;机制
中图分类号:
作者姓名:
何紫凝;袁中文;冯森玲
作者机构:
广州医科大学附属第三医院药学部/广东省产科重大疾病重点实验室,广州,510150
文献出处:
引用格式:
[1]何紫凝;袁中文;冯森玲-.基于网络药理学和分子对接研究丁香抗流感的作用机制)[J].世界中医药,2022(16):2263-2269
A类:
Predictiont,rhamnazin,isoquercitrin,rhamnetin,galloylglucose
B类:
网络药理学,分子对接,对接研究,丁香,抗流感,系统药理学,分析平台,TCMSP,文献筛选,活性成分,SwissTarget,GeneCards,交集,Cytoscape,String,数据库构建,蛋白质相互作用,PPI,Metascape,基因本体,富集分析,京都基因和基因组百科全书,Autodock,Vina,关键蛋白,流感病毒,病毒蛋白,glucopyranoside,quercetin,glucuronide,methyl,tetra,MAPKs,AKT1,TP53,EGFR,CASP3,HSP90AA1,免疫反应,生物过程,PI3,趋化因子,甲型流感,HA,NA,M2,蛋白结合,多成分,多靶点,多通路,免疫应答,病毒复制
AB值:
0.32948
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