典型文献
多环境下玉米保绿相关性状遗传位点的挖掘
文献摘要：
[目的]功能性保绿通常被认为是包括玉米在内的主要作物品种的理想性状.挖掘新的控制玉米保绿相关位点和候选基因,为玉米保绿遗传研究提供理论基础.[方法]以150份由许178和K12组配的重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体为材料,通过 Windows QTL Cartographer V2.5 的复合区间作图法(composite interval mapping,CIM)对 3个保绿相关性状(保绿度(visual stay green,VSG)、吐丝期绿叶数(green leaf number at silking stage,GLNS)和成熟期绿叶数(green leaf number at mature stage,GLNM))进行QTL定位.同时,以139份自然材料组成的关联群体为材料,基于混合线性模型(mixed linear model,MLM),结合50 790个高质量SNP标记,对这3个性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).[结果]基于CIM,利用单环境下的表型值和最佳线性无偏估计值(best linear unbiased prediction,BLUP)对GLNM、GLNS和VSG进行定位,共检测到37个QTL,分布在除第10染色体以外的其他染色体上,LOD范围为2.58-11.36,表型贡献率为4.34％-22.40％.GLNM、GLNS和 VSG性状分别检测到14、12和11个位点.其中,4个遗传稳定的QTL(qGLNS2-1、qVSG1-1、qVSG1-2和qVSG7-1),在3个及以上不同单环境中同时被检测到.利用MLM对保绿相关性状进行全基因组关联分析,共检测到44个超过阈值线的显著SNP,根据SNP标记在B73参考基因组的物理位置,发现共有15个位点落在连锁分析定位到的QTL区间内.[结论]通过QTL定位和全基因组关联分析共同检测到4个遗传稳定的共定位遗传区段(对应的B73参考基因组V4版物理位置区间为第1染色体6.2-8.2 Mb、第2染色体209.1-221.4 Mb、第6染色体96.8-102.1 Mb、第7染色体4.9-11.4 Mb),并挖掘到4个与光合作用和抗逆相关的候选基因(Zm00001d006119、Zm00001d018975、Zm00001d006535和 Zm00001d036763).
文献关键词：
玉米;保绿性;全基因组关联分析;QTL定位
中图分类号：
作者姓名：
常立国;何坤辉;刘建超
作者机构：
西北农林科技大学农学院/农业农村部西北旱区玉米生物与遗传改良重点实验室/陕西省玉米工程技术研究中心,陕西杨凌712100
文献出处：
引用格式：
[1]常立国;何坤辉;刘建超-.多环境下玉米保绿相关性状遗传位点的挖掘)[J].中国农业科学,2022(16):3071-3081
A类：
GLNS,GLNM,qGLNS2,qVSG1,qVSG7,Zm00001d006119,Zm00001d018975,Zm00001d006535,Zm00001d036763
B类：
多环境,相关性状,性状遗传,遗传位点,作物品种,制玉,候选基因,遗传研究,K12,组配,重组自交系,recombinant,inbred,lines,RIL,Windows,QTL,Cartographer,V2,作图法,composite,interval,mapping,CIM,visual,stay,green,吐丝,绿叶数,leaf,number,silking,stage,成熟期,mature,自然材料,材料组成,混合线性模型,mixed,linear,model,MLM,SNP,全基因组关联分析,genome,wide,association,study,GWAS,单环,无偏估计,估计值,best,unbiased,prediction,BLUP,LOD,个位,B73,参考基因,连锁分析,共定位,区段,V4,Mb,光合作用,抗逆,保绿性
AB值：
0.348784
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