典型文献
菜豆花色全基因组关联分析
文献摘要：
以124份菜豆为试验材料,分别在2019年和2020年调查花色表型,利用全基因组关联分析(GWAS)的方法对调控花色的基因进行挖掘.结果 表明:2年间供试菜豆花色表型基本一致,仅有1份材料存在差异.对124份菜豆材料进行重测序共获得517.58 Gb的数据量(10×),通过与菜豆参考基因组比对,获得5130030个SNP,过滤后得到3701584个SNP.利用这些高质量的SNP基于压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)将菜豆花色调控基因定位在6号染色体322.67 kb的区域内;在候选区域内共鉴定到8个基因,其中,Phvul.006G020200为参与花青素调控的MYB转录因子基因,且在不同花色材料中差异性表达,为调控菜豆花色的关键候选基因.
文献关键词：
菜豆;全基因组关联分析;花色;表达
中图分类号：
作者姓名：
卢甜甜;刘志远;徐兆生;张合龙;李国亮;折红兵;钱伟
作者机构：
中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081
文献出处：
引用格式：
[1]卢甜甜;刘志远;徐兆生;张合龙;李国亮;折红兵;钱伟-.菜豆花色全基因组关联分析)[J].园艺学报,2022(02):332-340
A类：
cMLM,Phvul,006G020200
B类：
菜豆,豆花,全基因组关联分析,花色表型,GWAS,控花,重测序,共获,Gb,数据量,参考基因,SNP,混合线性模型,compress,mixed,linear,model,花色调控,调控基因,基因定位,kb,候选区域,花青素,MYB,同花,差异性表达,候选基因
AB值：
0.325363
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