典型文献
桃的花型性状相关SNP位点挖掘与候选基因分析
文献摘要：
桃的花型分为铃型和蔷薇型,铃型花朵小且边缘卷曲,蔷薇型花朵大且完全展开,蔷薇型重瓣花是观赏桃育种者追求的主要目标性状之一.目前,与桃铃型/蔷薇型花型性状连锁的分子标记研究较少,限制了桃的花型性状分子标记辅助育种进程.为了鉴定与桃花型关联的单核苷酸多态性(SNP,single-nucleotide polymorphisms)位点并挖掘候选基因,本研究通过对199份桃品种进行重测序,获得了 1042687个SNP.采用一般线性模型对桃花型性状进行全基因组关联分析(GWAS,genome wide association study),获得7个与 目标性状显著关联的位点,其中2个位于2号染色体,5个位于8号染色体.进而对8号染色体的3个SNP进行竞争性等位基因特异性PCR(KASP,kompetitive allele-specific PCR)分型,在5个F1群体中进行进一步验证.x2验证结果表明:Chr.8:14484624 bp与桃花型性状显著关联.5个F1群体基因型和表型的对应关系表明,Chr.8:14484624 bp准确率最高,为93.46％.组织特异表达结果显示,在上述定位区间内的6个注释基因中,Prupe.8G118100在花中特异表达,将其视为桃花型性状的候选基因.本研究鉴定了桃铃型/蔷薇型花型性状关联位点,并对候选基因进行了筛选,以上结果可进一步转化为分子标记,用于观赏桃分子标记辅助选择育种.
文献关键词：
观赏桃育种;重测序;单核苷酸多态性;候选基因
中图分类号：
作者姓名：
孟歌;朱更瑞;方伟超;陈昌文;王新卫;王力荣;曹珂
作者机构：
中国农业科学院郑州果树研究所,郑州450009
文献出处：
引用格式：
[1]孟歌;朱更瑞;方伟超;陈昌文;王新卫;王力荣;曹珂-.桃的花型性状相关SNP位点挖掘与候选基因分析)[J].植物遗传资源学报,2022(02):505-517
A类：
观赏桃育种,8G118100
B类：
花型,SNP,候选基因分析,蔷薇,花朵,卷曲,重瓣花,目标性,连锁,分子标记辅助育种,桃花,单核苷酸多态性,single,nucleotide,polymorphisms,重测序,一般线性模型,全基因组关联分析,GWAS,genome,wide,association,study,个位,竞争性,等位基因,因特,KASP,kompetitive,allele,specific,x2,Chr,bp,基因型,特异表达,注释基因,Prupe,性状关联,分子标记辅助选择育种
AB值：
0.29446
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