典型文献
基于高密度遗传图谱对水稻粒形QTL定位及分析
文献摘要：
通过对水稻粒形相关性状进行QTL定位和不同位点的聚合效应分析,为后续辅助育种、粒形相关基因的精细定位奠定基础.在3个不同的季节种植籼稻品种魔大穗与航恢315的192个重组自交系群体,根据全基因组重测序技术构建的高密度遗传图谱,利用完备区间作图法(inclusive composite interval mapping,ICIM)定位水稻粒形性状QTL,并用复合区间作图法(CIM)对结果进行验证.对粒长、粒宽、长宽比、千粒重、谷粒截面积、谷粒周长进行QTL定位,ICIM法和CIM法分别检测到65个和81个QTL,其中有40个QTL能同时被检测到,成簇分布于2号、3号、5号、7号、8号、9号染色体上.将其归类为6个QTL簇,其中Loci5、Loci7、Loci9能被重复定位到,且控制至少4个性状,表型贡献率最高分别为15.74％、54.07％、15.89％,这些位点是后续基因功能研究的候选位点.根据bin标记分型结果将不同子代在各个QTL区间分为航恢315型和魔大穗型,在重组自交系后代进行聚合效应分析.经处理及数据分析发现聚合增效等位基因数量越多的个体,其在不同环境对应的表型值也越高.鉴定到携带多个增效等位基因的株系,可作为育种实践中增效等位基因的供体亲本.
文献关键词：
水稻;重组自交系;高密度遗传图谱;粒形;QTL定位
中图分类号：
作者姓名：
宋博文;王朝欢;赵哲;陈淳;黄明;陈伟雄;梁克勤;肖武名
作者机构：
华南农业大学/国家植物航天育种工程技术研究中心,广东广州 510642;广州市农业科学研究院,广东广州 510338
文献出处：
引用格式：
[1]宋博文;王朝欢;赵哲;陈淳;黄明;陈伟雄;梁克勤;肖武名-.基于高密度遗传图谱对水稻粒形QTL定位及分析)[J].作物学报,2022(11):2813-2825
A类：
Loci5,Loci7,Loci9
B类：
高密度遗传图谱,水稻粒形,QTL,形相,相关性状,聚合效应,辅助育种,精细定位,籼稻,重组自交系,全基因组重测序,技术构建,作图法,inclusive,composite,interval,mapping,ICIM,粒长,长宽比,千粒重,谷粒,截面积,周长,长进,最高分,基因功能,功能研究,bin,记分,子代,大穗型,后代,等位基因,不同环境,株系,育种实践,供体,亲本
AB值：
0.290945
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