典型文献
棉籽大小与形状关联标记发掘及候选基因筛选
文献摘要：
棉籽在油脂、饲料加工等领域具有重要用途,且影响纤维产量和品质.为发掘棉籽性状遗传位点与候选基因,利用419份具有丰富遗传变异的棉花品种资源构成的自然群体,在2个年度鉴定其棉籽性状,结合群体重测序SNP基因型进行全基因组关联分析.结果发现,供试群体棉籽长度、宽度、长宽比、面积与周长等性状存在较大遗传变异,变异系数3.91％～9.55％;有7个SNPs在2年同时被检测到与棉籽大小和形状关联,有23个SNPs在1年与3个以上棉籽相关性状关联,其中D11染色体D11:50561153在2年与粒宽、面积和周长关联,D12染色体D12:56031535在2年与粒长、面积和周长关联;同时,D05染色体在2年检测到4个与籽粒长宽比显著关联SNPs,A07染色体检测到10个与粒长、周长和面积关联SNPs,且单倍型间相关性状差异极显著.进一步分析发现,关联位点附近存在21个候选基因随棉花胚珠发育进程表达量呈现增加趋势,其中GhD05GO148编码乙烯调控反应的EBF蛋白(EIN3-binding F-box protein),该基因在棉花开花后1-35 d的胚珠中优势表达,且以开花后10d表达量最高;同时,候选基因Gh_D05G0144编码胚珠发育相关YABBY转录因子,该基因在棉花开花后20-35 d的胚珠中表达量较高,推测与棉籽后期发育有关.以上结果为棉籽多性状同步改良提供了选择标记与基因,为实现纤维和棉籽性状同步遗传改良奠定了基础.
文献关键词：
棉花;棉籽大小;棉籽形状;关联分析;候选基因
中图分类号：
作者姓名：
柯会锋;孙正文;王国宁;孟成生;吴立强
作者机构：
河北农业大学农学院,华北作物改良与调控国家重点实验室,河北保定071001;河北农业大学生命科学学院,河北保定071001
文献出处：
引用格式：
[1]柯会锋;孙正文;王国宁;孟成生;吴立强-.棉籽大小与形状关联标记发掘及候选基因筛选)[J].中国农业科技导报,2022(11):76-86
A类：
棉籽大小,GhD05GO148,D05G0144,棉籽形状
B类：
关联标记,候选基因筛选,油脂,饲料加工,纤维产量,产量和品质,性状遗传,遗传位点,遗传变异,棉花品种,品种资源,资源构成,合群,重测序,基因型,全基因组关联分析,长宽比,周长,SNPs,相关性状,性状关联,D11,D12,粒长,年检,籽粒,A07,单倍型,胚珠,发育进程,调控反应,EBF,EIN3,binding,box,protein,花开花,10d,YABBY,多性状,选择标记,遗传改良
AB值：
0.31699
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