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典型文献
柳枝稷BiP基因的鉴定、表达分析和抗逆境功能
文献摘要:
有害环境条件对植物生长发育有不利影响,并会引起蛋白质变性或错误折叠.分子伴侣之一的绑定蛋白(BiP)通过减轻错误折叠蛋白质引起的内质网应激发挥重要的保护作用.柳枝稷(Panicum virgatum L.)是一种原产于北美、多年生C4型禾本科植物.由于其生物量大、适应性强,近年来被作为能源植物研究和利用.为明确柳枝稷中BiP基因及其在逆境下的表达和功能,本研究通过对柳枝稷基因组数据本地BLAST比对,结合具有BiP保守结构域和内质网驻留信号序列(HDEL)特征筛选的条件,共在柳枝稷基因组中鉴定出4个BiP基因,命名为PvBiP1a、PvBiP1b、PvBiP2、PvBiP3,分别位于1号和5号染色体上.多物种序列比对和进化分析结果表明,PvBiPs具有BiP蛋白典型功能结构域,PvBiP1a和PvBiP1b聚成一个进化枝,并与水稻OsBiP1聚为一类,都含有7个内含子结构;PvBiP2与PvBiP3聚为另一进化枝,无内含子结构.上游2 kb启动子序列分析结果表明,PvBiPs主要包括胁迫防御和激素应答顺式作用元件.PvBiPs受内质网胁迫诱导剂二硫苏糖醇诱导表达,在NaCl、PEG、ABA和CdCl2胁迫下表现出上调表达,PvBiP2相对表达量的峰值最高.将PvBiP1a、PvBiP2与PvBiP3克隆至pGAD426载体并转化酵母,在CdCl2、NaCl和甘露醇胁迫下进行耐性验证,结果显示,3个基因对镉和盐胁迫都有耐性,对甘露醇胁迫无耐性.本研究结果将为深入挖掘柳枝稷BiP基因功能、提升柳枝稷在逆境下尤其是对重金属镉胁迫的耐性提供理论基础.
文献关键词:
柳枝稷;BiP;表达分析;胁迫;酵母转化
作者姓名:
宋刚;方志刚;王玉龙;蔡庆生
作者机构:
江苏农林职业技术学院茶与食品科技学院,江苏 句容 212400;南京农业大学生命科学学院,江苏 南京 210095;喀什大学生命与地理科学学院,新疆 喀什 844099
文献出处:
引用格式:
[1]宋刚;方志刚;王玉龙;蔡庆生-.柳枝稷BiP基因的鉴定、表达分析和抗逆境功能)[J].江苏农业学报,2022(04):889-899
A类:
HDEL,PvBiP1a,PvBiP1b,PvBiP2,PvBiP3,PvBiPs,OsBiP1,pGAD426
B类:
柳枝稷,表达分析,抗逆,逆境,对植,植物生长发育,蛋白质变性,错误折叠,分子伴侣,绑定,内质网应激,Panicum,virgatum,原产,产于,北美,多年生,C4,禾本科植物,生物量,能源植物,植物研究,研究和利用,表达和功能,基因组数据,BLAST,保守结构域,驻留,特征筛选,共在,多物种,序列比对,进化分析,功能结构,水稻,内含子,kb,启动子序列,序列分析,胁迫防御,激素应答,顺式作用元件,诱导剂,二硫苏糖醇,诱导表达,NaCl,PEG,ABA,CdCl2,出上,相对表达量,甘露醇,耐性,盐胁迫,基因功能,重金属镉,镉胁迫,酵母转化
AB值:
0.303844
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