典型文献
Neoseq模式在新生儿脂肪酸氧化代谢类疾病筛查中的应用
文献摘要:
目的:探讨Neoseq模式在新生儿脂肪酸氧化代谢类疾病(fatty acid oxidation disorders,FAOD)筛查与诊断中的应用价值。方法:采用回顾性病例对照研究方法,以常州地区2015年4月至2021年4月出生的163 500例活产新生儿作为研究对象,分别采用2种模式进行FAOD筛查与诊断。(1)传统模式:所有新生儿足跟采血进行串联质谱(tandem mass spectrum,TMS)筛查,初筛阳性者召回复查,并进行二代测序(next generation sequencing,NGS)基因包检测及其他鉴别诊断。(2)Neoseq模式:对传统模式确诊病例(真阳性组)、TMS初筛结果阴性样本(初筛阴性组)以及TMS初筛假阳性样本(初筛假阳性组)进行Neoseq检测分析。比较分析2种模式对FAOD的检出率、额外发现、报告周期等参数。对数据采用描述性统计方法进行分析。结果:(1)FAOD的筛查和诊断情况:基于传统模式筛查诊断18例FAOD确诊病例,本地区FAOD发病率为1/9 083。TMS初筛阳性率为0.55%(907/163 500),复查阳性率为0.04%(73/163 500),阳性预测值为2.0%(18/907),阳性召回样本中98%(889/907)为假阳性。(2)Neoseq筛查效果:①18例确诊病例中的16例检测到致病基因突变,2种筛查模式的突变位点符合率为16/18。2例确诊病例Neoseq未检出,包括1例β-酮硫解酶缺乏检出1个致病性突变位点,1例中链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症未检出致病性突变。②在57例TMS初筛假阳性样本中,Neoseq均未发现致病基因突变。③100例TMS初筛阴性样本中,Neoseq额外检出1例
DUOX2杂合突变,1例
MTTL1半合子突变。④18例样本采用传统模式的中位报告周期为43.5 d(28.0~104.0 d),而采用Neoseq模式则为12.0 d(10.0~15.0 d)。
结论:Neoseq对于FAOD的检出率较高。Neoseq同步TMS筛查,可降低FAOD生化筛查的假阳性率;可在较短时间明确遗传学病因,缩短疾病诊断周期;同时可拓展生化筛查以外的病种。
文献关键词:
婴儿,新生,疾病;脂肪酸类;代谢缺陷,先天性;串联质谱法;高通量核苷酸序列分析
中图分类号:
作者姓名:
杨宇奇;郭方;龙伟;韩小亚;虞斌
作者机构:
常州市妇幼保健院医学遗传科 常州市新生儿疾病筛查中心,常州 213023
文献出处:
引用格式:
[1]杨宇奇;郭方;龙伟;韩小亚;虞斌-.Neoseq模式在新生儿脂肪酸氧化代谢类疾病筛查中的应用)[J].中华围产医学杂志,2022(07):530-537
A类:
Neoseq,MTTL1
B类:
脂肪酸氧化代谢,代谢类疾病,疾病筛查,fatty,acid,oxidation,disorders,FAOD,筛查与诊断,回顾性病例对照研究,常州,活产,传统模式,新生儿足跟采血,tandem,mass,spectrum,TMS,初筛,阳性者,召回,回复,复查,二代测序,next,generation,sequencing,NGS,包检测,鉴别诊断,确诊病例,阳性样本,检测分析,描述性统计,统计方法,诊断情况,筛查诊断,阳性预测值,筛查效果,致病基因,基因突变,筛查模式,突变位点,符合率,未检,硫解酶,致病性,酰基,基辅,辅酶,缺乏症,DUOX2,杂合突变,合子,生化筛查,假阳性率,遗传学病因,疾病诊断,可拓,病种,婴儿,脂肪酸类,代谢缺陷,先天性,串联质谱法,高通量核苷酸序列分析
AB值:
0.303285
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