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从江香猪CD53基因的组织表达和结构变异多态性研究
文献摘要：
基于比较基因组学,在猪源白细胞表面抗原CD53基因中发现一段265 bp的结构变异(Structure Variant,SV).为了研究该结构变异在不同猪种中的多态性变化,本研究采用RT-qPCR检测从江香猪各组织中CD53基因mRNA的表达差异,并建立了结构变异CD53-I4-SV265的PCR检测方法,应用建立的检测方法分析从江香猪与大白猪结构变异的多态性分布.结果发现,CD53基因在肺脏中表达量最高,其次在脾脏与肠中大量表达,在背最长肌与垂体中表达量最低;在从江香猪与大白猪中,该结构变异的频率分布存在明显的差异,从江香猪以缺失的DD基因型为主,大白猪均为杂合的ID基因型,从等位基因频率上看,香猪缺失的D等位基因频率明显高于大白猪.在结构变异区域中检测到多种剪接调控元件(ESE/ISE),可能影响CD53基因的表达效率和转录本加工.本文研究结果表明,CD53基因中的结构变异CD53-I4-SV265可能与香猪较强的抗病力有关.
文献关键词：
香猪;CD53基因;结构变异;多态性
中图分类号：
作者姓名：
孙勇;齐芬芳;犹龙江;黄世会;牛熙;冉雪琴;王嘉福
作者机构：
贵州大学动物科学学院/农业生物工程研究院,贵州贵阳550025
文献出处：
引用格式：
[1]孙勇;齐芬芳;犹龙江;黄世会;牛熙;冉雪琴;王嘉福-.从江香猪CD53基因的组织表达和结构变异多态性研究)[J].中国畜牧杂志,2022(03):74-78
A类：
SV265
B类：
从江香猪,CD53,组织表达,结构变异,多态性,比较基因组学,猪源,细胞表面,表面抗原,bp,Structure,Variant,异在,qPCR,表达差异,I4,大白猪,肺脏,脾脏,背最长肌,垂体,频率分布,DD,基因型,杂合,ID,等位基因频率,剪接,ESE,ISE,表达效率,转录本,抗病力
AB值：
0.25938
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