典型文献
香蕉UEV基因家族鉴定及其表达分析
文献摘要:
泛素结合酶变体蛋白(Ubiquitin-conjugating E2 enzyme variant,UEV),又称为类泛素结合酶蛋白家族.为了解UEV是否参与调控香蕉(Musa)成熟,利用TAIR数据库,ExPASy和MEME在线软件,获取香蕉UEV基因,分析其编码蛋白理化性质和结构,构建UEV蛋白家族进化树,比较不同采后时间香蕉中MaUEV相对表达差异.结果表明,香蕉中共鉴定到UEV基因13个,MaUEV基因编码区域471~1 637 bp,编码氨基酸数量127~495个,分子量14 212.34~56 209.83 Da,等电点均小于7;8个MaUEV为稳定蛋白,5个MaUEV为不稳定蛋白,13个MaUEV均为亲水性蛋白,均由α-螺旋、β-转角、扩展链结构、无规则卷曲组成.除MaUEV3定位在叶绿体、细胞质和细胞核外,其他基因都定位在细胞核.除了 MaUEV4没有内含子外,其余12个MaUEV基因均由内含子和外显子组成.香蕉后熟过程中,MaUEV9相对表达量逐渐下降并在成熟时显著下调,MaUEV13相对表达量逐渐增加并在成熟时显著上调,推测MaUEV9和MaUEV13在香蕉后熟过程中作用不同.
文献关键词:
香蕉;UEV基因;泛素;相对表达量;后熟
中图分类号:
作者姓名:
何冰;武爱龙;沈一跃;郑佳明;吴建阳
作者机构:
湛江幼儿师范专科学校,广东湛江,524037;岭南师范学院基础教育学院,广东湛江524037
文献出处:
引用格式:
[1]何冰;武爱龙;沈一跃;郑佳明;吴建阳-.香蕉UEV基因家族鉴定及其表达分析)[J].中国南方果树,2022(06):57-62,70
A类:
泛素结合酶变体,MaUEV,MaUEV3,MaUEV4,MaUEV9,MaUEV13
B类:
香蕉,基因家族鉴定,表达分析,Ubiquitin,conjugating,E2,enzyme,variant,白家,Musa,TAIR,ExPASy,MEME,编码蛋白,性质和结构,家族进化,进化树,采后,表达差异,基因编码,编码区,bp,分子量,Da,等电点,亲水性,链结构,无规则,卷曲,叶绿体,细胞质,细胞核,内含子,外显子,子组,后熟,相对表达量
AB值:
0.29994
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