目的 通过生物信息学方法构建原发性干燥综合征(primary Sj?gren's syndrome,pSS)患者唾液腺组织中的竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络并探讨其发病机制.方法 利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)对pSS患者唾液腺组织中的信使 RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱作差异分析.通过miRcode数据库和3个miRNA数据库(TargetScan、miRDB和miRWalk)获取与 pSS 有关的靶微小 RNA(microRNA,miRNA)和靶 mRNA,构建 lncRNA-miRNA-mRNA 的ceRNA 调控网络,对ceRNA网络中差异表达基因(differentially expressed mRNAs,DEmRNAs)进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析.结果 在ceRNA网络中有214个DEmRNAs.KEGG分析显示DEmRNAs的主要富集信号通路为丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路和腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)信号通路,DEmRNAs 中 10 个枢纽(Hub)基因分别为 JUN、CCND1、NRAS、DDX5、KAT2B、VEGFA、SIRT1、CLTA、MCM7 和 RPS6KA1.结论 本研究通过构建ceRNA调控网络,发现网络中DEmRNAs主要富集MAPK和AMPK信号通路,为进一步深入探讨原发性干燥综合征的诊断和治疗提供了新的思路.

原发性干燥综合征;ceRNA调控网络;生信分析;信使RNA;长链非编码RNA;微小RNA

230032合肥,安徽医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,炎症免疫性疾病安徽省实验室

[1]吴玲玲;凌华云;周颖;邱丽娟;王红;薛昱;陈慧娟;王廷睿;王斌-.原发性干燥综合征患者唾液腺组织ceRNA调控网络的构建)[J].中华疾病控制杂志,2022(07):777-783,814

KAT2B,CLTA,RPS6KA1

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