典型文献
基于网络药理学及分子对接技术探讨血必净注射液治疗新型冠状病毒肺炎的潜在靶标及机制
文献摘要:
目的 采用网络药理学和分子对接的方法探讨血必净注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在调控机制.方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得血必净注射液所有有效活性成分的干预靶点,并与GeneCards数据库、OMIM数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库和DrugBank数据库中COVID-19基因相关靶标使用R编程语言取交集,从而获得血必净注射液治疗COVID-19的核心靶标;利用Cytoscape 3.7.2软件构建中药-化合物-靶标网络;通过STRING得到交集靶标的PPI网络;运用数据包进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测重叠靶点的作用机制.最后,应用分子对接技术,将关键有效活性成分和PPI中核心蛋白进行分子对接.结果 GO功能富集分析包括1 818个生物过程(biological process,BP),20种细胞组分(cel-lular component,CC)以及 89 种分子功能(molecular function,MF).前30条KEGG相关通路涉及炎症和免疫反应等,如类风湿性关节炎信号通路、IL-17信号通路、Th17细胞分化通路、缺氧诱导因子(HIF)-1信号通路、JAK-STAT信号通路、炎症性肠病信号通路、NF-κB信号通路等.槲皮素、隐丹参酮、木犀草素、β胡萝卜素可影响IL1B、STAT3、AKT1、VEGFA等重叠靶点,同时,槲皮素可能通过IL1B结合,发挥抗炎、抗病毒和免疫应答作用,治疗COVID-19.结论 本研究揭示了血必净注射液中的化学成分通过与关键靶蛋白结合涉及多种生物学过程及通路治疗COVID-19.
文献关键词:
网络药理学;分子对接;血必净注射液;新型冠状病毒肺炎
中图分类号:
作者姓名:
周辉芳;王君平;苏利波;王燕;孙涛涛;杨新英;张聪悦;谢英;孙殿兴
作者机构:
解放军联勤保障部队第九八○医院感染科,河北石家庄050082;河北医科大学实验动物学部,河北省实验动物重点实验室,河北 石家庄050017;解放军联勤保障部队第九八○医院全军肝病中心,河北石家庄050082
文献出处:
引用格式:
[1]周辉芳;王君平;苏利波;王燕;孙涛涛;杨新英;张聪悦;谢英;孙殿兴-.基于网络药理学及分子对接技术探讨血必净注射液治疗新型冠状病毒肺炎的潜在靶标及机制)[J].中国热带医学,2022(08):769-775
A类:
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,血必净注射液,靶标,调控机制,系统药理学,分析平台,TCMSP,活性成分,干预靶点,GeneCards,OMIM,PharmGkb,TTD,DrugBank,编程语言,交集,Cytoscape,软件构建,STRING,PPI,数据包,基因本体论,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,通路富集分析,核心蛋白,生物过程,biological,process,cel,lular,component,CC,molecular,function,MF,相关通路,免疫反应,类风湿性关节炎,Th17,细胞分化,缺氧诱导因子,HIF,JAK,炎症性肠病,槲皮素,隐丹参酮,木犀草素,胡萝卜素,IL1B,STAT3,AKT1,VEGFA,抗病毒,免疫应答,靶蛋白,蛋白结合,生物学过程
AB值:
0.312318
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