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首株分离自云南元谋猫的鼠疫噬菌体裂解谱及基因组学特性研究
文献摘要：
目的 以云南元谋鼠疫疫源地指示动物猫中分离到的一株鼠疫噬菌体为研究对象,通过观察其形态,并对其裂解谱及基因组特性进行研究,进一步丰富云南省鼠疫噬菌体数据库.方法 将鼠疫疫苗株EV76作为宿主菌,采用双层琼脂平板法从云南省鼠疫疫源地指示动物猫肛拭子中分离纯化噬菌体并测定其效价,利用透射电子显微镜观察其形态,单层平板法观察鼠疫噬菌体YMM68对66株菌在室温(约18～22℃)、28℃、37℃的裂解能力,提取该株鼠疫噬菌体的DNA进行二代测序,并利用生物信息学软件分析其基因组的特征与功能.结果 分离得到一株鼠疫噬菌体,将其命名为YMM68.该株鼠疫噬菌体噬菌斑清晰、大小均一,直径在(0.7～1.4)mm,透射电子显微镜观察其具有正二十面体头部和收缩性的尾部,其在室温(18～22℃)、28℃、37℃3个温度下均能裂解受试的鼠疫菌,还能裂解福氏志贺菌2a,其余的受试菌株不能被裂解.鼠疫噬菌体YMM68的基因组全长46 902 bp,G+C含量为50％,并发现YMM68的基因组上共编码71个蛋白,不编码tRNA基因,未发现抗生素抗性基因.结论 首次从云南元谋鼠疫疫源地指示动物猫中分离到一株鼠疫噬菌体,该株鼠疫噬菌体属于肌尾噬菌体,具有一定的裂解宽度,根据其裂解谱特性及基因组特性研究,具有一定的潜在应用价值.
文献关键词：
鼠疫;鼠疫噬菌体;裂解谱;猫;基因组学;指示动物
中图分类号：
作者姓名：
杨娇;钟佑宏;彭朴仙;刘攀;王鹏;王磊
作者机构：
大理大学公共卫生学院,云南大理671000;云南省地方病防治所,云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室,云南大理671000;昆明医科大学公共卫生学院,云南昆明650500
文献出处：
引用格式：
[1]杨娇;钟佑宏;彭朴仙;刘攀;王鹏;王磊-.首株分离自云南元谋猫的鼠疫噬菌体裂解谱及基因组学特性研究)[J].疾病监测,2022(09):1159-1164
A类：
YMM68
B类：
元谋,鼠疫噬菌体,裂解谱,基因组学,鼠疫疫源地,指示动物,一株,通过观察,基因组特性,鼠疫疫苗,疫苗株,EV76,宿主菌,琼脂,肛拭子,分离纯化,效价,透射电子显微镜,二代测序,利用生物,生物信息学软件,菌斑,均一,二十面体,收缩性,尾部,鼠疫菌,福氏志贺菌,2a,基因组全长,bp,G+C,tRNA,抗生素抗性基因,潜在应用
AB值：
0.216072
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