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云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物戊型肝炎病毒感染及基因多态性研究
文献摘要：
目的:了解云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物戊型肝炎病毒（hepatitis E virus，HEV）感染情况及基因多态性。方法:2019年7 - 8月，在云南省家鼠鼠疫疫源地的16个自然村（弥勒市4个、芒市6个、梁河县6个）周围，采用夹夜法收集鼠形动物，提取肝脏RNA，应用一步法荧光定量PCR检测鼠HEV目的基因，计算鼠HEV阳性率；采用PCR法对阳性样本进行目的基因扩增及克隆测序，应用MegAlign和MEGA 7.0软件对测序样本序列与GenBank注册的HEV基因序列进行序列对比分析，构建系统进化树。结果:共捕获鼠形动物491只，隶属3目、5科、8属、15种；鼠HEV阳性率为4.89%（24/491），其中黄胸鼠和针毛鼠的阳性率分别为9.39%（23/245）和1/3，其他鼠形动物未检出。不同生境鼠形动物鼠HEV阳性率比较差异有统计学意义（
P = 0.014），且民居附近生境鼠HEV阳性率高于其他生境（
P均< 0.05）。序列对比分析结果显示，来源于梁河县的P018样本基因序列与来自香港首例感染鼠HEV患者的样本MG813927.1序列同源性为100.0%，且与MG813927.1及来源于鼠的样本LC549185.1序列聚为同一分支，为HEV C型；来源于芒市的G024样本与其他病毒株的序列同源性为20.7% ~ 31.5%，与来源于鸟类的样本AY535004.1序列聚为同一分支。
结论:云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物存在鼠HEV感染，可能存在基因多态性，且感染差异与生境有关。
文献关键词：
戊型肝炎病毒;鼠形动物;感染;基因多态性;鼠疫疫源地
中图分类号：
作者姓名：
朱俊洁;张垚;洪汝丹;李瑞;罗云燕;贺琪楠;刘思彤;左秀华;尹家祥
作者机构：
大理大学公共卫生学院，大理 671000;大理大学第一附属医院检验科，大理 671000
文献出处：
引用格式：
[1]朱俊洁;张垚;洪汝丹;李瑞;罗云燕;贺琪楠;刘思彤;左秀华;尹家祥-.云南省家鼠鼠疫疫源地鼠形动物戊型肝炎病毒感染及基因多态性研究)[J].中华地方病学杂志,2022(10):809-814
A类：
P018,MG813927,LC549185,G024,AY535004
B类：
家鼠鼠疫疫源地,地鼠,鼠形动物,戊型肝炎病毒,基因多态性,hepatitis,virus,HEV,感染情况,自然村,弥勒市,芒市,梁河县,夹夜法,一步法,目的基因,阳性样本,基因扩增,克隆测序,MegAlign,MEGA,GenBank,基因序列,建系,系统进化树,中黄,黄胸鼠,毛鼠,未检,不同生境,民居,首例,序列同源性,毒株,鸟类
AB值：
0.215842
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